RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 CEP290O15078 2479 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 MSCO60682 206 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 ARMCX2Q7L311 632 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 LY9Q9HBG7 655 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 GRM4Q14833 912 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 RASEFQ8IZ41 740 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 KLRF2D3W0D1 207 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 H0YGN5 161 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 CAPN2P17655 700 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.86■■□□□ 1.09
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PTPRU-211ENST00000531385 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 ADCY6O43306 1168 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 PGK1P00558 417 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 COL6A1P12109 1028 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 CALML3P27482 149 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 MCM5P33992 734 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 TROAPQ12815 778 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 ACVR2BQ13705 512 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 RARBP10826 455 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 AKR1A1P14550 325 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 HOMER1Q86YM7 354 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 KATNBL1Q9H079 304 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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PTPRU-211ENST00000531385 PTGS1P23219 599 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC41Q15345 812 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRU-211ENST00000531385 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRU-211ENST00000531385 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRU-211ENST00000531385 TBC1D5Q92609 795 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 DNM1LO00429 736 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 EVI5O60447 810 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 FBXO11Q86XK2 927 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ABCB11O95342 1321 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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PTPRU-211ENST00000531385 CPA1P15085 419 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 MTMR8Q96EF0 704 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM87BQ96K49 555 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 NEK1Q96PY6 1258 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRU-211ENST00000531385 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 MYADML2A6NDP7 307 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 KBTBD13C9JR72 458 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 FERMT2Q96AC1 680 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 PNMA2Q9UL42 364 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC69A6NI79 296 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ADAMTS4O75173 837 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRU-211ENST00000531385 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRU-211ENST00000531385 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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PTPRU-211ENST00000531385 COL20A1Q9P218 1284 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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