RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 AKR1A1P14550 325 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CNTN2Q02246 1040 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAF1Q13077 416 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 USH1GQ495M9 461 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 KBTBD13C9JR72 458 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF5BP33176 963 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ANO1Q5XXA6 986 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ARMCX2Q7L311 632 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO11Q86XK2 927 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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SH3BP2-210ENST00000505941 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 NEK1Q96PY6 1258 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCB11O95342 1321 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 B4DLN1 442 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 DNM1LO00429 736 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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SH3BP2-210ENST00000505941 ANTXR2P58335 489 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ACVR2BQ13705 512 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 GRM4Q14833 912 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.53■■□□□ 1.52
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SH3BP2-210ENST00000505941 MAF1Q9H063 256 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CALML3P27482 149 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF180Q86T96 592 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 AMNQ9BXJ7 453 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-210ENST00000505941 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 DDAH1O94760 285 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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SH3BP2-210ENST00000505941 CALM2P0DP24 149 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 CALM3P0DP25 149 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 LIFRP42702 1097 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 TROAPQ12815 778 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 RGS22Q8NE09 1264 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP3K14Q99558 947 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 LY9Q9HBG7 655 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 SPC25Q9HBM1 224 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.5■■□□□ 1.51
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SH3BP2-210ENST00000505941 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.5■■□□□ 1.51
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SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 SENP2Q9HC62 589 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB5O15062 677 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 FGD1P98174 961 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.48■■□□□ 1.51
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SH3BP2-210ENST00000505941 HOMER1Q86YM7 354 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 FGD4Q96M96 766 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 COL6A1P12109 1028 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 DNERQ8NFT8 737 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 H0YGN5 161 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 PDE4DQ08499 809 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC41Q15345 812 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BP2-210ENST00000505941 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 PGK1P00558 417 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 SMARCA1P28370 1054 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 TNFAIP2Q03169 654 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 RASEFQ8IZ41 740 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 MTMR8Q96EF0 704 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 PIGSQ96S52 555 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-210ENST00000505941 MYL10Q9BUA6 226 aa24.45■■□□□ 1.5
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