RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, human

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLXNA3-208	ENST00000495040		B4E1Z4	1266 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	ANKS1A	Q92625	1134 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	IL25	Q9H293	177 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	LAMA3	Q16787	3333 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	ACLY	P53396	1101 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	KAT14	Q9H8E8	782 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	KCNA10	Q16322	511 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	PNMA1	Q8ND90	353 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	LTBP2	Q14767	1821 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADCY6	O43306	1168 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	GJA9	P57773	515 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	TLE2	Q04725	743 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	LCT	P09848	1927 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	ASTN1	O14525	1302 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	LRCH3	Q96II8	777 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	NFIB	O00712	420 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	CHML	P26374	656 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	TNFAIP2	Q03169	654 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
PLXNA3-208	ENST00000495040	TNKS	O95271	1327 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	MYADML2	A6NDP7	307 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	NKX3-2	P78367	333 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	MORC4	Q8TE76	937 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	ASGR1	P07306	291 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	CLTB	P09497	229 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	GPR153	Q6NV75	609 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	VTA1	Q9NP79	307 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	ELP1	O95163	1332 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	TOX2	Q96NM4	488 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRDN	Q13061	729 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	BAD	Q92934	168 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	CPVL	Q9H3G5	476 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	CALML3	P27482	149 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PLXNA3-208	ENST00000495040	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	CTAGE5	O15320	804 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	PTH1R	Q03431	593 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	TLK2	Q86UE8	772 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040		Q9Y3F1	56 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	MYH6	P13533	1939 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	KIAA0355	O15063	1070 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	SGSM2	O43147	1006 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	CYP21A2	P08686	494 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	SMPD1	P17405	629 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	USH1G	Q495M9	461 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		31.12	■■■□□ 2.57

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