RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 FGD4Q96M96 766 aa28.38■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 PRC1O43663 620 aa28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 CNTN2Q02246 1040 aa28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 RGS22Q8NE09 1264 aa28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 MAD2L2Q9UI95 211 aa28.37■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 DNM1LO00429 736 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 REC8O95072 547 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 RARBP10826 455 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 LIFRP42702 1097 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 TROAPQ12815 778 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 TRAF1Q13077 416 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 ARMCX2Q7L311 632 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 FAM184BQ9ULE4 1060 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 NR2E3Q9Y5X4 410 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 ABCB11O95342 1321 aa28.36■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 COL6A1P12109 1028 aa28.35■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 ACVR2BQ13705 512 aa28.35■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.35■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.35■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 CPVLQ9H3G5 476 aa28.35■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 LY9Q9HBG7 655 aa28.35■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 NFIBO00712 420 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 DDAH1O94760 285 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 RNF207Q6ZRF8 634 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 FBXO11Q86XK2 927 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 NEK1Q96PY6 1258 aa28.34■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 LCTP09848 1927 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 PTPDC1A2A3K4 754 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 SOWAHBA6NEL2 793 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 QRICH1Q2TAL8 776 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 MCF2L2Q86YR7 1114 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 MTMR8Q96EF0 704 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 SENP2Q9HC62 589 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
EHD1-211ENST00000489379 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 CCDC69A6NI79 296 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 KBTBD13C9JR72 458 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 EVI5O60447 810 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 CALM1P0DP23 149 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 CALM2P0DP24 149 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 CALM3P0DP25 149 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 KIF5BP33176 963 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 USH1GQ495M9 461 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 ZNF654Q8IZM8 581 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 AMNQ9BXJ7 453 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 RIOX1Q9H6W3 641 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 CEP290O15078 2479 aa28.32■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 ALPK3Q96L96 1907 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 B4DLN1 442 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB5O15062 677 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 SMARCA1P28370 1054 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 DNERQ8NFT8 737 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 MORC4Q8TE76 937 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa28.31■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 GNAQP50148 359 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 ANO1Q5XXA6 986 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 RNF180Q86T96 592 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 KCNB2Q92953 911 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.3■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 RPS6P62753 249 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 LRRC41Q15345 812 aa28.29■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.29■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 NUP133Q8WUM0 1156 aa28.29■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 CALML3P27482 149 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 HSPA4P34932 840 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 CCDC144BQ3MJ40 725 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 KATNBL1Q9H079 304 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 VTA1Q9NP79 307 aa28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 ASTN1O14525 1302 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 SLC30A10Q6XR72 485 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 RASEFQ8IZ41 740 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 SPC25Q9HBM1 224 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 SLC12A7Q9Y666 1083 aa28.27■■■□□ 2.12
EHD1-211ENST00000489379 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms