RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 RAD50Q92878 1312 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 A0A1W2PQY0 241 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ASB14A6NK59 587 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 NFIBO00712 420 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 PTH1RQ03431 593 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 TNKSO95271 1327 aa22.03■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 LAMA4Q16363 1823 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ACLYP53396 1101 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 KCNA10Q16322 511 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 TDHQ8IZJ6 230 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 LRCH3Q96II8 777 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 TLE2Q04725 743 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.01■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 SZT2Q5T011 3432 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 PTPDC1A2A3K4 754 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 TNFAIP2Q03169 654 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 UBAC1Q9BSL1 405 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 PDLIM7Q9NR12 457 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 PDGFCQ9NRA1 345 aa22■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 SGSM2O43147 1006 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 CYP21A2P08686 494 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 PTGS1P23219 599 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 GJA9P57773 515 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 SPC25Q9HBM1 224 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.99■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 ASGR1P07306 291 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 CALML3P27482 149 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 USH1GQ495M9 461 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 GNASQ5JWF2 1037 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 PNMA2Q9UL42 364 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 LAMA3Q16787 3333 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 MCM3APO60318 1980 aa21.98■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 CTAGE5O15320 804 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 SMPD1P17405 629 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 BEX3Q00994 111 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 SEC23AQ15436 765 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 MORC4Q8TE76 937 aa21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 TRDNQ13061 729 aa21.96■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.96■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 BADQ92934 168 aa21.96■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.96■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.96■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.96■■□□□ 1.11
UPP1-211ENST00000482015 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 CLTBP09497 229 aa21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 ITGB8P26012 769 aa21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 TLK2Q86UE8 772 aa21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 SKAP1Q86WV1 359 aa21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 VTA1Q9NP79 307 aa21.95■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 E7EWF7 191 aa21.94■■□□□ 1.1
UPP1-211ENST00000482015 NKX3-2P78367 333 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms