RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 JMJD4Q9H9V9 463 aa4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 VAT1LQ9HCJ6 419 aa4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL20A1Q9P218 1284 aa4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 RAD50Q92878 1312 aa4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 PARP14Q460N5 1801 aa4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.67□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 KLRF2D3W0D1 207 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 DNM1LO00429 736 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 EVI5O60447 810 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 CPA1P15085 419 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMPD1P17405 629 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 EDNRBP24530 442 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 RPS6P62753 249 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 NKX3-2P78367 333 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 SNX17Q15036 470 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNA10Q16322 511 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 CREB3L3Q68CJ9 461 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHRDL2Q6WN34 429 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 NSMFQ6X4W1 530 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 IQCA1Q86XH1 822 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARRDC4Q8NCT1 418 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNB2Q92953 911 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 TAAR1Q96RJ0 339 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 MYL10Q9BUA6 226 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 KAT14Q9H8E8 782 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 CNNM2Q9H8M5 875 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 LY9Q9HBG7 655 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 FBXO40Q9UH90 709 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 PHF24Q9UPV7 400 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRIN2DO15399 1336 aa4.66□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF236Q9UL36 1845 aa4.65□□□□□ -1.66
UBE2Q1-204ENST00000476612 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 A0A1W2PQY0 241 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 MSCO60682 206 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 RGS20O76081 388 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARIH2O95376 493 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC34A2O95436 690 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 RARBP10826 455 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 NT5C2P49902 561 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 CDK7P50613 346 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 GJA9P57773 515 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 RTP1P59025 263 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 BEX3Q00994 111 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 TLE2Q04725 743 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 FUT2Q10981 343 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRM4Q14833 912 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 USH1GQ495M9 461 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 RGS22Q8NE09 1264 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 NCOA7Q8NI08 942 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 COPS5Q92905 334 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 VWCEQ96DN2 955 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.7 ms