RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	TKFC	Q3LXA3	575 aa		12.99	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	NSMF	Q6X4W1	530 aa		12.99	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		12.99	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		12.99	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		12.99	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		12.99	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		12.98	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	LTBP2	Q14767	1821 aa		12.98	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYTH3	O43739	400 aa		12.98	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTGS1	P23219	599 aa		12.98	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARMCX2	Q7L311	632 aa		12.98	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		12.98	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	KATNBL1	Q9H079	304 aa		12.98	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERICH2	A1L162	156 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLRF2	D3W0D1	207 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	POTEB2	H3BUK9	544 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	OPLAH	O14841	1288 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEPT4	O43236	478 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCM5	P33992	734 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSPA4	P34932	840 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTMR8	Q96EF0	704 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDAH1	O94760	285 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOMER1	Q86YM7	354 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D5	Q92609	795 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNB2	Q92953	911 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIGS	Q96S52	555 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL20A1	Q9P218	1284 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GTPBP1-208	ENST00000475959	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYADML2	A6NDP7	307 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL6A1	P12109	1028 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALML3	P27482	149 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF20	Q5VTR2	975 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM87B	Q96K49	555 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCB11	O95342	1321 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGK1	P00558	417 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIFR	P42702	1097 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MICU3	Q86XE3	530 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO11	Q86XK2	927 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTA3	Q9BTC8	594 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC69	A6NI79	296 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB5	O15062	677 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSC	O60682	206 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAMTS4	O75173	837 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	AKR1A1	P14550	325 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACVR2B	Q13705	512 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC41	Q15345	812 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOA5	Q6Q788	366 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MORC4	Q8TE76	937 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNM1L	O00429	736 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	REC8	O95072	547 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		12.92	□□□□□ -0.34

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