RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARMCX2Q7L311 632 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMTC2Q8N394 836 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC69A6NI79 296 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KBTBD13C9JR72 458 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NFIBO00712 420 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 REC8O95072 547 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KRT32Q14532 448 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRM4Q14833 912 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNM1LO00429 736 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CALML3P27482 149 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACVR2BQ13705 512 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXO11Q86XK2 927 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LY9Q9HBG7 655 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SENP2Q9HC62 589 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCB11O95342 1321 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDAH1O94760 285 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIF5BP33176 963 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 QRICH1Q2TAL8 776 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FGD4Q96M96 766 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEK1Q96PY6 1258 aa23■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TROAPQ12815 778 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRAF1Q13077 416 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF180Q86T96 592 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AMNQ9BXJ7 453 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZBTB5O15062 677 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOMER1Q86YM7 354 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B4DLN1 442 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CALM1P0DP23 149 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CALM2P0DP24 149 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CALM3P0DP25 149 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL6A1P12109 1028 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LIFRP42702 1097 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGS22Q8NE09 1264 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAP3K14Q99558 947 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAF1Q9H063 256 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPC25Q9HBM1 224 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 H0YGN5 161 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GNAQP50148 359 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FGD1P98174 961 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC41Q15345 812 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYL10Q9BUA6 226 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PGK1P00558 417 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RASEFQ8IZ41 740 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDE4DQ08499 809 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNERQ8NFT8 737 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIGSQ96S52 555 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VTA1Q9NP79 307 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP290O15078 2479 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASTN1O14525 1302 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms