RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.65■■□□□ 1.38
ANKRD39-201ENST00000393537 PGK1P00558 417 aa23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CHST3Q7LGC8 479 aa23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ASTN1O14525 1302 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ERICH2A1L162 156 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ASB14A6NK59 587 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 USH1GQ495M9 461 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 WTAPQ15007 396 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF180Q86T96 592 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 KATNBL1Q9H079 304 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SENP2Q9HC62 589 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC27A2O14975 620 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SYN1P17600 705 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ANTXR2P58335 489 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 FERMT2Q96AC1 680 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ADCY6O43306 1168 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTS4O75173 837 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC45O75419 566 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CALML3P27482 149 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CASC1Q6TDU7 716 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 PHF24Q9UPV7 400 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 KLRF2D3W0D1 207 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 NECTIN1Q15223 517 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RTP1P59025 263 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 GRM4Q14833 912 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCB11O95342 1321 aa23.58■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO11Q86XK2 927 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MORC4Q8TE76 937 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PRO3102Q9H379 93 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MYADML2A6NDP7 307 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PRC1O43663 620 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFAIP2Q03169 654 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 TROAPQ12815 778 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 SPC25Q9HBM1 224 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PQY0 241 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MCM5P33992 734 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 ACLYP53396 1101 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 SNX17Q15036 470 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS22Q8NE09 1264 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 LY9Q9HBG7 655 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 VTA1Q9NP79 307 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 GJA9P57773 515 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNA10Q16322 511 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.54■■□□□ 1.36
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM60Q495X7 471 aa23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms