RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.8■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 CLCN1P35523 988 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 TNNI2P48788 182 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 RASA3Q14644 834 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 TMX2Q9Y320 296 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 SMTNL1A8MU46 457 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 TXLNAP40222 546 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 POTEDQ86YR6 584 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.79■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 FZD9O00144 591 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 IKBKBO14920 756 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 DPYDQ12882 1025 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 MICALL2Q8IY33 904 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 DRC7Q8IY82 874 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 SMC2O95347 1197 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 TDP2O95551 362 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 CAP2P40123 477 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 MTRQ99707 1265 aa25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.77■■□□□ 1.72
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L15C9J2P7 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L11C9JVI0 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L18D6R9N7 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L22D6RA61 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L19D6RCP7 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L20D6RJB6 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 SLC37A4O43826 429 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L24Q0WX57 530 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 DISC1Q9NRI5 854 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 UBA7P41226 1012 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 MYL5Q02045 173 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K10Q02779 954 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.76■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
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VSTM4-201ENST00000298454 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 TECP42680 631 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 AMNQ9BXJ7 453 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 CDC25BP30305 580 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 STAT6P42226 847 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 MMP14P50281 582 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 TPM4P67936 248 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 USH1GQ495M9 461 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 MLKLQ8NB16 471 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 DPF2Q92785 391 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 TEPSINQ96N21 525 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR9Q96QG7 549 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 GOPCQ9HD26 462 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.75■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
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VSTM4-201ENST00000298454 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.74■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO11Q86XK2 927 aa25.74■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.74■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 PLIN2Q99541 437 aa25.74■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.74■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 TXKP42681 527 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 CALCRLQ16602 461 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 PTGS1P23219 599 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 STAT2P52630 851 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 CUL4BQ13620 913 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 AK8Q96MA6 479 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 GSDMAQ96QA5 445 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.73■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 TNFAIP1Q13829 316 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 MEIS2O14770 477 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 ATP1A3P13637 1013 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 CABP7Q86V35 215 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC15Q8TF66 581 aa25.72■■□□□ 1.71
VSTM4-201ENST00000298454 VCPKMTQ9H867 229 aa25.72■■□□□ 1.71
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