RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 FosP01101 380 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aco1P28271 889 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sdc2P43407 202 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf180Q3U827 592 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif3j2Q66JS6 263 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 MyripQ8K3I4 856 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dph6Q9CQ28 267 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A1L1SQF0 893 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Btn2a2A4QPC6 514 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stx1aO35526 288 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcif1P59114 706 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef16Q3U5C8 713 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rasa3Q60790 834 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 RragbQ6NTA4 374 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnksr2Q80YA9 1032 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gga3Q8BMI3 718 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubiad1Q9DC60 336 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sertad1Q9JL10 236 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pex3Q9QXY9 372 aa13.3□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tulp1Q9Z273 543 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mms22lB1AUR6 1238 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5134E9QAB5 671 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nedd1P33215 660 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Siglec10Q80ZE3 688 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ehd2Q8BH64 543 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acat1Q8QZT1 424 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 S1pr4Q9Z0L1 386 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 ThbdP15306 577 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Islr2Q5RKR3 745 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bri3bpQ8BXV2 253 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 MslnlQ8C160 685 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinb13Q8CDC0 389 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fzd9Q9R216 592 aa13.29□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rsph10bE9PYQ0 876 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vgll2Q8BGW8 322 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sgip1Q8VD37 806 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bhmt2Q91WS4 363 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krtap5-3Q9D226 196 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Erich6bQ9D4S6 220 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9DAQ4 598 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col2a1P28481 1487 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr78E9PYY5 807 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Has3O08650 554 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 AoahO35298 574 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbm46P86049 533 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eepd1Q3TGW2 569 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hdac4Q6NZM9 1076 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snrnp35Q9D384 244 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmod4Q9JLH8 345 aa13.28□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa13.27□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 EporP14753 507 aa13.27□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Meis2P97367 477 aa13.27□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cabp7Q91ZM8 215 aa13.27□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fsip1Q9D3V5 435 aa13.27□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa13.27□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ulk4Q3V129 1303 aa13.27□□□□□ -0.28
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap4B1AUY3 965 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zkscan7E9PVW1 718 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp2b1G5E829 1220 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Senp5Q6NXL6 749 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clec16aQ80U30 1036 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sapcd2Q9D818 391 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lamb1P02469 1786 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh14Q6URW6 2000 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr119Q7TRJ5 321 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcaf8Q8N7N5 591 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttc8Q8VD72 515 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Brms1Q99N20 246 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa13.27□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fyb2A2A995 729 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nr1i2O54915 431 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgfr2P21803 821 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxc10P31257 342 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stim2P83093 746 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 CnstQ8CBC4 711 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nap1l5Q9JJF0 156 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prg3Q9JL95 222 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fem1bQ9Z2G0 627 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh8P13542 1937 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Armc3A2AU72 881 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Skint3A7TZF0 458 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm38392E9Q2A2 434 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm15448F6PZL4 682 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm4758L7N258 96 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdha4O88689 947 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cbx2P30658 519 aa13.26□□□□□ -0.29
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxa11P31311 313 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.1 ms