Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
Tmod4Q9JLH8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Tmod4Q9JLH8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Tmod4Q9JLH8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Tmod4Q9JLH8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Tmod4Q9JLH8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Tmod4Q9JLH8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Tmod4Q9JLH8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Tmod4Q9JLH8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Tmod4Q9JLH8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Tmod4Q9JLH8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Tmod4Q9JLH8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tmod4Q9JLH8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tmod4Q9JLH8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Tmod4Q9JLH8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Tmod4Q9JLH8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Tmod4Q9JLH8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Tmod4Q9JLH8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Tmod4Q9JLH8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Tmod4Q9JLH8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tmod4Q9JLH8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Tmod4Q9JLH8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Tmod4Q9JLH8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Tmod4Q9JLH8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Tmod4Q9JLH8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tmod4Q9JLH8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Tmod4Q9JLH8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Tmod4Q9JLH8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Tmod4Q9JLH8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Tmod4Q9JLH8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Tmod4Q9JLH8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Tmod4Q9JLH8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Tmod4Q9JLH8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Tmod4Q9JLH8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Tmod4Q9JLH8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tmod4Q9JLH8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tmod4Q9JLH8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tmod4Q9JLH8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tmod4Q9JLH8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tmod4Q9JLH8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Tmod4Q9JLH8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tmod4Q9JLH8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tmod4Q9JLH8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Tmod4Q9JLH8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tmod4Q9JLH8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Tmod4Q9JLH8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tmod4Q9JLH8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tmod4Q9JLH8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tmod4Q9JLH8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Tmod4Q9JLH8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Tmod4Q9JLH8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Tmod4Q9JLH8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Tmod4Q9JLH8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Tmod4Q9JLH8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tmod4Q9JLH8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Tmod4Q9JLH8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tmod4Q9JLH8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tmod4Q9JLH8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tmod4Q9JLH8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tmod4Q9JLH8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tmod4Q9JLH8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Tmod4Q9JLH8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tmod4Q9JLH8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tmod4Q9JLH8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tmod4Q9JLH8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tmod4Q9JLH8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tmod4Q9JLH8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tmod4Q9JLH8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tmod4Q9JLH8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Tmod4Q9JLH8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Tmod4Q9JLH8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tmod4Q9JLH8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tmod4Q9JLH8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tmod4Q9JLH8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tmod4Q9JLH8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tmod4Q9JLH8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tmod4Q9JLH8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tmod4Q9JLH8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tmod4Q9JLH8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tmod4Q9JLH8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tmod4Q9JLH8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tmod4Q9JLH8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tmod4Q9JLH8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tmod4Q9JLH8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Tmod4Q9JLH8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Tmod4Q9JLH8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Tmod4Q9JLH8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Tmod4Q9JLH8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tmod4Q9JLH8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Tmod4Q9JLH8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Tmod4Q9JLH8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tmod4Q9JLH8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tmod4Q9JLH8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tmod4Q9JLH8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Tmod4Q9JLH8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tmod4Q9JLH8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Tmod4Q9JLH8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
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