RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa11.02□□□□□ -0.64
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp20Q8C6M1 916 aa11.02□□□□□ -0.64
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttc19Q8CC21 365 aa11.02□□□□□ -0.64
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmed5Q9CXE7 229 aa11.02□□□□□ -0.64
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Speer4bQ9D9F7 267 aa11.02□□□□□ -0.64
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa11.02□□□□□ -0.64
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trappc3O55013 180 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc138Q0VF22 680 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cep70Q6IQY5 616 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GypcQ78HU7 95 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cep104Q80V31 926 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GopcQ8BH60 463 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttc22Q8C159 568 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slain2Q8CI08 581 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc12a6Q924N4 1150 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CatspereP0DP43 985 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Shox2P70390 331 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gspt2Q149F3 632 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trappc10Q3TLI0 1259 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xlr3bQ6P205 226 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf131Q8K3J5 619 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim29Q8R2Q0 587 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q91WD4 421 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbm43Q99J64 343 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fmnl1Q9JL26 1094 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igsf9bE9PZ19 1328 aa11.02□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Api5O35841 504 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gap43P06837 227 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdh15P33146 784 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rasa2P58069 847 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hdhd2Q3UGR5 259 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acad11Q80XL6 779 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Frmd7A2AD83 703 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clcn6O35454 870 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr182P43142 395 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pdrg1P59048 133 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam170aQ66LM6 333 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PrimpolQ6P1E7 537 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nme8Q715T0 586 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp17leQ7M764 540 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdr64Q9D565 1086 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chrna9G3X8Z7 479 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sec23aQ01405 765 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp781Q0P5U5 243 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rgs9bpQ148R9 237 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q3TYL0 343 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc65Q8VHI7 493 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arl2bpQ9D385 163 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myo1hQ9D6A1 958 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Efcc1Q9JJF6 558 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Col14a1Q80X19 1797 aa11.01□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MarcksP26645 309 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sept1P42209 366 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Epb41l4aP52963 686 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pls1Q3V0K9 630 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GapdhsQ64467 440 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sptlc3Q8BG54 563 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnot10Q8BH15 744 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gimap5Q8BWF2 308 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajc28Q8VCE1 385 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdha5Q91Y15 934 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cmtr1Q9DBC3 837 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MeiocA2AG06 965 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Casp4P70343 373 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ces1eQ64176 562 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Naa15Q80UM3 865 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MefvQ9JJ26 767 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bcl9lQ67FY2 1494 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cep85lA0A1W2P884 806 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam186bD3Z420 943 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt74Q6IFZ9 495 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stambpl1Q76N33 436 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Txndc16Q7TN22 820 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf41Q8BH75 317 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scfd2Q8BTY8 684 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc122Q8BVN0 290 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Exoc1Q8R3S6 894 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Capn9Q9D805 690 aa11□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa10.99□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5134E9QAB5 671 aa10.99□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnnc1P19123 161 aa10.99□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cep131Q62036 1060 aa10.99□□□□□ -0.65
Nedd1-201ENSMUST00000020163 WlsQ6DID7 541 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms