RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W UBX3Q12229 455 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W IDI1P15496 288 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W EMC1P25574 760 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W PEX3P28795 441 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MUP3P38734 546 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YHR131CP38835 850 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W FCY21P40039 528 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ARH1P48360 493 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MSE1P48525 536 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W RAI1P53063 387 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W EFM5P53200 248 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data10.19□□□□□ -0.78not detected
PRP4YPR178W YNR063WP53749 607 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ABZ2Q03266 374 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W APC4Q04601 652 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MDM36Q06820 579 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W THP3Q12049 470 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W TRM10Q12400 293 aa10.19□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W PBS2P08018 668 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YCK2P23292 546 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W AAT2P23542 418 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W PPZ1P26570 692 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GAC1P28006 793 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W BEM1P29366 551 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SYN8P31377 255 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W COX13P32799 129 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MRPL17P36528 281 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ECM13P38195 257 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YBR053CP38235 358 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W CEM1P39525 442 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GCD10P41814 478 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W AIM23P47015 356 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NAS6P50086 228 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W BOL2P53082 120 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GND2P53319 492 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YDR131CQ03899 556 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W BCH1Q05029 724 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W BUD7Q08754 746 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YLR049CQ12110 428 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MHF1Q3E835 90 aa10.18□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W PUT2P07275 575 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W STF2P16965 84 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MEI5P32489 222 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MRS6P32864 603 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W HCS1P34243 683 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W CLG1P35190 452 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W CAF4P36130 643 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SLX1P38324 304 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YHR078WP38799 552 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W REF2P42073 533 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W FAR7P43592 221 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W IBD2P53892 351 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W PML39Q03760 334 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W PPN1Q04119 674 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YPR196WQ06595 470 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W RIB3Q99258 208 aa10.17□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W LAA1P39526 2014 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W UBR2Q07963 1872 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W RAD7P06779 565 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W COS2P0CX12 379 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W COS3P0CX13 379 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NSP1P14907 823 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NTG1P31378 399 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ARP2P32381 391 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W PTM1P32857 523 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MRPL6P32904 214 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SKT5P34226 696 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W FMP23P38231 175 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W IPT1P38954 527 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W COS4P43542 379 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NET1P47035 1189 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W PET117Q02771 107 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ARA2Q04212 335 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W AIM32Q04689 311 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W BLS1Q06071 122 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W HSP42Q12329 375 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data10.16□□□□□ -0.78not detected
PRP4YPR178W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa10.16□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YUR1P26725 428 aa10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SBA1P28707 216 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W STE14P32584 239 aa10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SHE3P38272 425 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MSC7P38694 644 aa10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MTG2P38860 518 aa10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W TPA1P40032 644 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ARO8P53090 500 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SPP2Q02521 185 aa10.15□□□□□ -0.78
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