RNA–Protein interactions for RNA: YPL219W

PCL8, Transcript of Cyclin, yeast

Gene PCL8, Length 1,479 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PCL8	YPL219W	PXL1	P36166	706 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	MRPL4	P36517	319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	SLM4	P38247	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	BZZ1	P38822	633 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	GET2	P40056	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	YFR018C	P43599	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	DSL1	P53847	754 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	YFH1	Q07540	174 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	GSH2	Q08220	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	ULA1	Q12059	462 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	POM34	Q12445	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	TPK2	P06245	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	HIP1	P06775	603 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	YIH1	P25637	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	YME2	P32843	850 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	MSN4	P33749	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	SEC66	P33754	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	PMT1	P33775	817 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	TOD6	P34219	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	MRPL37	P36532	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	AGP2	P38090	596 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	MSG5	P38590	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
PCL8	YPL219W	AIM20	P40451	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	HXT14	P42833	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	ELP2	P42935	788 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	EFM3	P47163	339 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	YDL183C	P48569	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	PRM1	P53835	661 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	BOP3	P53958	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	GCN5	Q03330	439 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	LDB17	Q12342	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	AHC1	Q12433	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	SOD2	P00447	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	UNG1	P12887	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	PET18	P25362	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	BUD14	P27637	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	PHO11	P35842	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	TPO5	P36029	618 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	ECM4	P36156	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	PHO12	P38693	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	CCT6	P39079	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	PLB1	P39105	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	FTR1	P40088	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	IAH1	P41734	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	SMC3	P47037	1230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	PET130	P47065	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	MTL1	P53214	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	MED4	Q12343	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCL8	YPL219W	GAL80	P04387	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SEC12	P11655	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	CDC42	P19073	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SEC15	P22224	910 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SNT1	P25357	1226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	KAR4	P25583	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	CDC20	P26309	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	CDC15	P27636	974 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SFB3	P38810	929 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	PET100	P38958	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	IME4	P41833	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	YGL242C	P53066	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	CSI1	Q04368	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	AIM41	Q12032	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	TAF3	Q12297	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	CBP1	P07252	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	TUP1	P16649	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	PEX1	P24004	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SRB4	P32569	687 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	KKQ8	P36004	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	EHT1	P38295	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SIP3	P38717	1229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	AFG3	P39925	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCL8	YPL219W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
PCL8	YPL219W	FKH2	P41813	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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