RNA–Protein interactions for RNA: YMR089C

YTA12, Transcript of Mitochondrial inner membrane m-AAA protease component, yeast

Gene YTA12, Length 2,478 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YTA12	YMR089C	SSO2	P39926	295 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	ASG1	P40467	964 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	SMC3	P47037	1230 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	PGA2	P53903	129 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	PPM1	Q04081	328 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	LOT6	Q07923	191 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	VPS63	O13549	108 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	CDC4	P07834	779 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	BUD14	P27637	709 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	ERC1	P38767	581 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	SER3	P40054	469 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	ARH1	P48360	493 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	FMS1	P50264	508 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	BUD7	Q08754	746 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	TGS1	Q12052	315 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	UPC2	Q12151	913 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	GLE1	Q12315	538 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	SFG1	Q12507	346 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	TPK2	P06245	380 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	STE3	P06783	470 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YCR061W	P25639	631 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	GEX2	P36173	615 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YAR028W	P39548	234 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	GSM1	P42950	618 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YFR018C	P43599	363 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YJL045W	P47052	634 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	RSN1	Q03516	953 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YLR173W	Q06247	608 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	CRN1	Q06440	651 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	COQ1	P18900	473 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	BOS1	P25385	244 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	DEP1	P31385	405 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	SUA5	P32579	426 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YPT7	P32939	208 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YKL070W	P36087	169 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	BDH2	P39713	417 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	ALG5	P40350	334 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YRB2	P40517	327 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YGR066C	P53242	292 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	NSG2	P53898	299 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YMR102C	Q03177	834 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	YDR444W	Q04093	687 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	SVS1	Q12254	260 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YTA12	YMR089C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	YBR139W	P38109	508 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	ATG14	P38270	344 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	ICP55	P40051	511 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	IRC4	Q03036	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	YMR074C	Q04773	145 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	TRE1	Q08919	783 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	YOR022C	Q12204	715 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	NTO1	Q12311	748 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	LDB19	Q12502	818 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	RAD61	Q99359	647 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	MRP10	O75012	95 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	FBP1	P09201	348 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	SEC66	P33754	206 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	PMT1	P33775	817 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	SLM4	P38247	162 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	RFC5	P38251	354 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	SFB3	P38810	929 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	MTW1	P39731	289 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	ECM27	P47144	725 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	COQ6	P53318	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	ATG21	Q02887	496 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	YLR455W	Q06188	304 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	YLL007C	Q07799	665 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	TMA16	Q08687	178 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	PTR2	P32901	601 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	LRG1	P35688	1017 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	CMC1	P36064	111 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	MAL33	P38157	468 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	TDP1	P38319	544 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	FTR1	P40088	404 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	ELO3	P40319	345 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	AIM6	Q07716	390 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YTA12	YMR089C	HOS1	Q12214	470 aa		5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.7 ms