RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	FAR3	P46671	204 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	SNG1	P46950	547 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	NPA3	P47122	385 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	POP6	P53218	158 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	GPI1	P53306	609 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YPR003C	P53394	754 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	IBD2	P53892	351 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	TEP1	P53916	434 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PIR3	Q03180	325 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	TRS130	Q03660	1102 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YLR455W	Q06188	304 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	BSC6	Q08280	497 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	COX17	Q12287	69 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PRM7	Q12459	698 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	SKM1	Q12469	655 aa		0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PRB1	P09232	635 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PEP5	P12868	1029 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	SIR1	P21691	654 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	MAK32	P23060	363 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	MEF1	P25039	761 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ADH7	P25377	361 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	AGA1	P32323	725 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	UBP11	P36026	717 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YPT10	P38146	199 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	AVT5	P38176	459 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	VID24	P38263	362 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RTS1	P38903	757 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	MGS1	P40151	587 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	TMA108	P40462	946 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CSM2	P40465	213 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	IDP2	P41939	412 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CTK2	P46962	323 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YMR155W	Q03795	547 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	GTB1	Q04924	702 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CDD1	Q06549	142 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RAD34	Q06665	692 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	HNT3	Q08702	217 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	APM4	Q99186	491 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	AMD2	P22580	549 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PCL1	P24867	279 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PEP3	P27801	918 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	NDI1	P32340	513 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	NPL6	P32832	435 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ECM15	P35195	104 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	STB6	P36085	766 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	APM3	P38153	483 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CDS1	P38221	457 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ARP1	P38696	384 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CIN4	P39110	191 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PKP1	P40530	394 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YIP5	P53108	310 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RSM23	Q01163	450 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	MRPL13	Q02204	264 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	CAC2	Q04199	468 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YLR001C	Q07895	862 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YDL009C	Q12210	107 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YPS3	Q12303	508 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	ARP7	Q12406	477 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	NKP1	Q12493	238 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YML133C	Q03099	1374 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YLL067C	Q07888	1374 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YLL066C	Q99208	1374 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YFL068W	P0CX99	160 aa		0.2	□□□□□ -2.38
SOV1	YMR066W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		0.2	□□□□□ -2.38

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