RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	AKR2	Q12013	749 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	LAG2	Q92325	660 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SRN2	Q99176	213 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ARG3	P05150	338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ATR1	P13090	542 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PEX3	P28795	441 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	VAM7	P32912	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YKL100C	P34248	587 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ETR1	P38071	380 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YBR284W	P38150	797 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PEX32	P38292	413 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YHL017W	P38745	532 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YAP1801	P38856	637 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	AKR1	P39010	764 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	IES5	P40060	125 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PIG2	P40187	538 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	FET5	P43561	622 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SPO74	P45819	413 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SAE2	P46946	345 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PEX8	P53248	589 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	MUK1	Q02866	612 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	UME1	Q03010	460 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	VHS1	Q03785	461 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GAD1	Q04792	585 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	THI73	Q07904	523 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SSP2	Q08646	371 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	TRM11	Q12463	433 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PTC5	Q12511	572 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	VCX1	Q99385	411 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	INH1	P01097	85 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	FBP1	P09201	348 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	MRP13	P12686	339 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	DMC1	P25453	334 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ATG22	P25568	528 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	NUP133	P36161	1157 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PPS1	P38148	807 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RFC3	P38629	340 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YMR134W	P40207	237 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	COS4	P43542	379 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	COS5	P47187	383 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	GCV1	P48015	400 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YKE2	P52553	114 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	COG1	P53079	417 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	LSB1	P53281	241 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	COS1	P53822	381 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	DID2	P69771	204 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	SED5	Q01590	340 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	OSH6	Q02201	448 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	IRC4	Q03036	179 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ACL4	Q03771	387 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RAD30	Q04049	632 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PDR8	Q06149	701 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ESC8	Q08119	714 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PGC1	Q08959	321 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	DCN1	Q12395	269 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	ATG31	Q12421	196 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	AHC1	Q12433	566 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YPT6	Q99260	215 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	VMR1	P38735	1592 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	CDC23	P16522	626 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	YPK2	P18961	677 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	AMD2	P22580	549 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	NPP1	P25353	742 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	HES1	P35843	434 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RRN11	YML043C	PET10	P36139	283 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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