RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W TFB1P32776 642 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MDL1P33310 695 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W SEC66P33754 206 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W NUP133P36161 1157 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W TSC10P38342 320 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W DBP8P38719 431 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YJL055WP47044 245 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MRK1P50873 501 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YLR455WQ06188 304 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W VTA1Q06263 330 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W FMP45Q07651 309 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CLC1P17891 233 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MAK32P23060 363 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W SPO11P23179 398 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W TKL1P23254 680 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YCR006CP25350 157 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W GSY2P27472 705 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ERV1P27882 189 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W SAC1P32368 623 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RXT2P38255 430 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W IMD2P38697 523 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MSR1P38714 643 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W GDI1P39958 451 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CDC1P40986 491 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W STB2P46679 850 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W IMD3P50095 523 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ERG26P53199 349 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W FMP30Q02883 468 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W PDS5Q04264 1277 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ECM30Q06673 1274 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ISN1Q99312 450 aa4.74□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W HXT3P32466 567 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RPL32P38061 130 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ANS1P38832 159 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CAJ1P39101 391 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YIL166CP40445 542 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W TCB2P48231 1178 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ORC5P50874 479 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YGR016WP53209 190 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W SLI1P53304 468 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W OAZ1Q02803 292 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W KAP120Q02932 1032 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W IRC10Q08118 586 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data4.73□□□□□ -1.65not detected
YKR047WYKR047W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa4.73□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W GPA1P08539 472 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W KRS1P15180 591 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CPR2P23285 205 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W PPH22P23595 377 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W HCS1P34243 683 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W PXL1P36166 706 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W APD1P38281 316 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CIN4P39110 191 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W PAC2P39937 518 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W SEC28P40509 296 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CIN1P40987 1014 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data4.72□□□□□ -1.65not detected
YKR047WYKR047W YTP1P53584 459 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RSM23Q01163 450 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W PDR8Q06149 701 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MCH4Q08268 501 aa4.72□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ARG81P05085 880 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W ANP1P32629 500 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W YKL100CP34248 587 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W PEX25Q02969 394 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W MSC1Q03104 513 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W SOV1Q04748 898 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W COQ9Q05779 260 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W IRC3Q06683 689 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W CDC45Q08032 650 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W GPM3Q12326 303 aa4.71□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W ELO2P25358 347 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W TOA1P32773 286 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W YME2P32843 850 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W OCT1P35999 772 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W TUL1P36096 758 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W STU2P46675 888 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W TPO3Q06451 622 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W BSP1Q06604 576 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W SUT2Q12286 268 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W PNS1Q12412 539 aa4.7□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W CLB2P24869 491 aa4.69□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W GAC1P28006 793 aa4.69□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W MGM1P32266 881 aa4.69□□□□□ -1.66
YKR047WYKR047W RML2P32611 393 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.7 ms