RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YHL049C	P38722	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YEL075C	P39972	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YER189W	P40104	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YFL064C	P43540	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YDL183C	P48569	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	COG6	P53959	839 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FMN1	Q03778	218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YLH47	Q06493	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	IRC3	Q06683	689 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	TCO89	Q08921	799 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YPR089W	O13585	888 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RIT1	P23796	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	GPI10	P30777	616 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TFC4	P33339	1025 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RPC37	P36121	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YPT10	P38146	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	FES1	P38260	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PEX18	P38855	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	EXO1	P39875	702 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SYG1	P40528	902 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ATG36	P46983	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YJL043W	P47053	257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SAP4	P53036	818 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TAF6	P53040	516 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	USE1	P53146	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	HOP2	P53187	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TRE2	Q08693	809 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
POP4	YBR257W	PCL8	Q08966	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	BUG1	Q12191	341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	FLO11	P08640	1367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SEC63	P14906	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SPO16	P17122	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CLN1	P20437	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RPC34	P32910	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CSE1	P33307	960 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YKL050C	P35736	922 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	HES1	P35843	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MSG5	P38590	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	HIS2	P38635	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PET100	P38958	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	END3	P39013	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YEL076C	P39971	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ASE1	P50275	885 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SHE4	P51534	789 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MIG2	P53035	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MUB1	Q03162	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PPN1	Q04119	674 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	INM2	Q05533	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ARR3	Q06598	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RUP1	Q12242	671 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	GSC2	P40989	1895 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	WHI2	P12611	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CBF1	P17106	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	EXO70	P19658	623 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	BRF1	P29056	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	COY1	P34237	679 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	FAT1	P38225	669 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YBR071W	P38243	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	VHC1	P38329	1120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SPC97	P38863	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	STN1	P38960	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CAB2	P40506	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DSL1	P53847	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CBK1	P53894	756 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	NSE5	Q03718	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ACL4	Q03771	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	FMP42	Q04991	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CDC26	P14724	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CNA1	P23287	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MRPL25	P23369	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RRT12	P25381	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RGT1	P32862	1170 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms