RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 CASC1Q6TDU7 716 aa18.17■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.17■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 MAML3Q96JK9 1138 aa18.17■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 RNF208Q9H0X6 261 aa18.17■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.17■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 SNAP25P60880 206 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 WDR78Q5VTH9 848 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 LHX8Q68G74 356 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 CHST3Q7LGC8 479 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 DPP9Q86TI2 863 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 MMP19Q99542 508 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 MAP3K14Q99558 947 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 LY9Q9HBG7 655 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 FBXO40Q9UH90 709 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.16■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 LIFRP42702 1097 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 CCDC96Q2M329 555 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 TRPV1Q8NER1 839 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 TMEM87BQ96K49 555 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 MTMR7Q9Y216 660 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.15■□□□□ 0.5
BECN1-211ENST00000589636 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 PGK2P07205 417 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CYBAP13498 195 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 MCM5P33992 734 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 KCTD2Q14681 263 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 GRM4Q14833 912 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 RNF20Q5VTR2 975 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 FAM133AQ8N9E0 248 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CLEC4DQ8WXI8 215 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 USP26Q9BXU7 913 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CPVLQ9H3G5 476 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 RIOX1Q9H6W3 641 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 PRC1O43663 620 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 MYCP01106 439 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CYP2C19P33261 490 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 WTAPQ15007 396 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 TMTC2Q8N394 836 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 NEK1Q96PY6 1258 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 MAF1Q9H063 256 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 PNMA2Q9UL42 364 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18.13■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 MFSD14CQ5VZR4 134 aa18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 FBXL16Q8N461 479 aa18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 RGS22Q8NE09 1264 aa18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 DEFB118Q96PH6 123 aa18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 TINF2Q9BSI4 451 aa18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 ACAD9Q9H845 621 aa18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 RNF146Q9NTX7 359 aa18.12■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 KLRF2D3W0D1 207 aa18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CYTH3O43739 400 aa18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 REC8O95072 547 aa18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 SMARCA1P28370 1054 aa18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CCDC174Q6PII3 467 aa18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 ASTN1O14525 1302 aa18.11■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 LCTP09848 1927 aa18.1■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 ERICH2A1L162 156 aa18.1■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.1■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
BECN1-211ENST00000589636 ALAS1P13196 640 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms