RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CENPFP49454 3210 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 FLT3LGP49771 235 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 FGD1P98174 961 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 TNS4Q8IZW8 715 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 KLRF2D3W0D1 207 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CALM1P0DP23 149 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CALM2P0DP24 149 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CALM3P0DP25 149 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 RUFY3Q7L099 469 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 FBXL16Q8N461 479 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 MYL10Q9BUA6 226 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CPVLQ9H3G5 476 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 GJD2Q9UKL4 321 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF536O15090 1300 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 PTPREP23469 700 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 SNAP25P60880 206 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 IRF5Q13568 498 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 RAET1EQ8TD07 263 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 STRNO43815 780 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 ICAM1P05362 532 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 KIF5BP33176 963 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 GRB14Q14449 540 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 MORN1Q5T089 497 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC174Q6PII3 467 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 APOA5Q6Q788 366 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 Q6ZUG5 572 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 PNMA2Q9UL42 364 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 RIPK3Q9Y572 518 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 MICU3Q86XE3 530 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CHST13Q8NET6 341 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 USP6NLQ92738 828 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 FBXO40Q9UH90 709 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-208ENST00000588667 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 FCER1AP12319 257 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 MAP2K5Q13163 448 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 TKFCQ3LXA3 575 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 BRF1Q92994 677 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 RXRAP19793 462 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 RGS2P41220 211 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 RCAN1P53805 252 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 46
ATG4D-208ENST00000588667 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 ZBTB43O43298 467 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 ADORA2AP29274 412 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 GNAQP50148 359 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 KCTD2Q14681 263 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 FANCBQ8NB91 859 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 MMP19Q99542 508 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 APBA2Q99767 749 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 RNF146Q9NTX7 359 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 ADCY3O60266 1144 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 ALAS1P13196 640 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 MTMR8Q96EF0 704 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 ACAD9Q9H845 621 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 HOXC6P09630 235 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 CYP2B6P20813 491 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 SMARCA1P28370 1054 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 GRK4P32298 578 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 APOBRQ0VD83 1088 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 NBPF11Q86T75 865 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 ABHD8Q96I13 439 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-208ENST00000588667 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms