RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP2A1O14983 1001 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTS4O75173 837 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHDP01880 384 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTGS1P23219 599 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC16A2P36021 539 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 NSMFQ6X4W1 530 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARMCX2Q7L311 632 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF180Q86T96 592 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM160B2Q86V87 743 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHST13Q8NET6 341 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 BADQ92934 168 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 GMCL1Q96IK5 515 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGD4Q96M96 766 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACAD9Q9H845 621 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXO40Q9UH90 709 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHF24Q9UPV7 400 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF536O15090 1300 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ORC4O43929 436 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGAP02671 866 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 OAZ1P54368 228 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACVR2BQ13705 512 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMC5Q8IY18 1101 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM161BQ96MY7 647 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEDD4P46934 1319 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 LAMA4Q16363 1823 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLTBP09497 229 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGB8P26012 769 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACLYP53396 1101 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 BEX3Q00994 111 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX17Q15036 470 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 SHHQ15465 462 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALX1Q15699 326 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNA10Q16322 511 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCAF4Q8WV16 495 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASTN1O14525 1302 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 LCTP09848 1927 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFIBO00712 420 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 FDX1P10109 184 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 SDSP20132 328 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUCB1Q02818 461 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPVLQ9H3G5 476 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZMYM6O95789 1325 aa8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms