RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAML3Q96JK9 1138 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF536O15090 1300 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ALAS1P13196 640 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF39Q9H2S5 420 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ACAD9Q9H845 621 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF146Q9NTX7 359 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 PNMA2Q9UL42 364 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.5□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYH4Q9Y623 1939 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC27A2O14975 620 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGHA2P01877 340 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ICAM1P05362 532 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 SEC23AQ15436 765 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF20Q5VTR2 975 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLXNB2O15031 1838 aa14.49□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 MSCO60682 206 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 WTAPQ15007 396 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NECTIN1Q15223 517 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHST3Q7LGC8 479 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TINF2Q9BSI4 451 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.48□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 POTEB2H3BUK9 544 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYBAP13498 195 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 LHX8Q68G74 356 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRPV1Q8NER1 839 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.47□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 PFASO15067 1338 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 SEPT4O43236 478 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 MCM5P33992 734 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NSMFQ6X4W1 530 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CPVLQ9H3G5 476 aa14.46□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 LAMA4Q16363 1823 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 PARP14Q460N5 1801 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRC1O43663 620 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANTXR2P58335 489 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMTC2Q8N394 836 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 DPF3Q92784 378 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 MTA3Q9BTC8 594 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.45□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLRF2D3W0D1 207 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNTN2Q02246 1040 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM87BQ96K49 555 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 SENP2Q9HC62 589 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.44□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 ASB14A6NK59 587 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 NFIBO00712 420 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 REC8O95072 547 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 KRT32Q14532 448 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRM4Q14833 912 aa14.43□□□□□ -0.1
USP3-AS1-205ENST00000560067 USH1GQ495M9 461 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms