RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 HMGCS2P54868 508 aa20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 DGKZQ13574 1117 aa20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 PKP1Q13835 747 aa20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 KRT40Q6A162 431 aa20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 PIGSQ96S52 555 aa20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.91■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L15C9J2P7 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L11C9JVI0 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L18D6R9N7 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L22D6RA61 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L19D6RCP7 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L20D6RJB6 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 F13A1P00488 732 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 MMP1P03956 469 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 SLC16A2P36021 539 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 USP17L24Q0WX57 530 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 SNAPC2Q13487 334 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
MFGE8-210ENST00000559259 STXBP3O00186 592 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 PPFIA3O75145 1194 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 IFNL1Q8IU54 200 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 AIFM3Q96NN9 605 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 CPVLQ9H3G5 476 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.89■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 DTNBO60941 627 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 BRAPQ7Z569 592 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 HOMER1Q86YM7 354 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 AMNQ9BXJ7 453 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.88■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 PTPRFP10586 1907 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 GTF2A2P52657 109 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 OAZ1P54368 228 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 COG2Q14746 738 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.87■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 MYH6P13533 1939 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 GPR25O00155 361 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 FLOT1O75955 427 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 CETPP11597 493 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 GNA11P29992 359 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 RESTQ13127 1097 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 MOGSQ13724 837 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 ATL3Q6DD88 541 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 LBX2Q6XYB7 198 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 FBXO11Q86XK2 927 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 BICD2Q8TD16 824 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 PTPN18Q99952 460 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 MAF1Q9H063 256 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.86■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 ATP2A1O14983 1001 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 DSG3P32926 999 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 NLRP5P59047 1200 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 MCTP2Q6DN12 878 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 KIFC2Q96AC6 838 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 SHISA4Q96DD7 197 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 C6orf50Q9HD87 102 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.85■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 ICAM1P05362 532 aa20.84■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 KRT2P35908 639 aa20.84■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 NAPAP54920 295 aa20.84■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 NPY5RQ15761 445 aa20.84■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
MFGE8-210ENST00000559259 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms