RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 CDK7P50613 346 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PDE4BQ07343 736 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 MFSD5Q6N075 450 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 C16orf59Q7L2K0 433 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 TIFAQ96CG3 184 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.224e-7■■□□□ 13
CS-221ENST00000550734 NAPBQ9H115 298 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 FAM184BQ9ULE4 1060 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 MYO9BQ13459 2157 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 TNFRSF10AO00220 468 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 FGRP09769 529 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PPARAQ07869 468 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 KCNA10Q16322 511 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ZMYM6O95789 1325 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 MROH7Q68CQ1 1323 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 XIRP2A4UGR9 3374 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 F5H6K3 240 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ATP2A1O14983 1001 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 KLRC3Q07444 240 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 TMEM240Q5SV17 173 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 FAM83BQ5T0W9 1011 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 TEX13BQ9BXU2 312 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PBX4Q9BYU1 374 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 A0A0D9SFI3 127 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 MYADML2A6NDP7 307 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PRDM1O75626 825 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 TTLL1O95922 423 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 GJA9P57773 515 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 NKX3-2P78367 333 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.221e-7■■□□□ 12.1
CS-221ENST00000550734 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 CCDC174Q6PII3 467 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 GLT1D1Q96MS3 346 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 SLF1Q9BQI6 1058 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 RIPK3Q9Y572 518 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 MCM3APO60318 1980 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 REV3LO60673 3130 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ADCY6O43306 1168 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ORC4O43929 436 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 FGAP02671 866 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ASGR1P07306 291 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 TSPY3P0CV98 308 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 TSPY8P0CW00 308 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PBX2P40425 430 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 NOVP48745 357 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ACVR2BQ13705 512 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 VPS53Q5VIR6 699 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 DDX11Q96FC9 970 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 CEP95Q96GE4 821 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 FAM227BQ96M60 508 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-221ENST00000550734 TRANK1O15050 2925 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 GRXCR1A8MXD5 290 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ARVCFO00192 962 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 NDUFB10O96000 172 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 CSF2RAP15509 400 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 SDSP20132 328 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 COL9A1P20849 921 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 TFAP4Q01664 338 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 FAM126BQ8IXS8 530 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 STK11IPQ8N1F8 1099 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 TMEM199Q8N511 208 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 FGD4Q96M96 766 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ASB2Q96Q27 587 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 MYH4Q9Y623 1939 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-221ENST00000550734 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
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