RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 IRF5Q13568 498 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 KRT32Q14532 448 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 GRM4Q14833 912 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MTFR1Q15390 333 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 SLC35G1Q2M3R5 365 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ASPRV1Q53RT3 343 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 NUP133Q8WUM0 1156 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 TRIB2Q92519 343 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ARMC5Q96C12 935 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ZNF333Q96JL9 665 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 TMEM87BQ96K49 555 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 APBA2Q99767 749 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MROH8Q9H579 483 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 FLRT1Q9NZU1 646 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CCDC69A6NI79 296 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 COBLO75128 1261 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 INHAP05111 366 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ALAS1P13196 640 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 RGS2P41220 211 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 OAZ1P54368 228 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 SOX10P56693 466 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MAP2K5Q13163 448 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MUM1L1Q5H9M0 696 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CATIPQ7Z7H3 387 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 NBPF11Q86T75 865 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ADGRF4Q8IZF3 695 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MMP19Q99542 508 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MTA3Q9BTC8 594 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 WDR19Q8NEZ3 1342 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 KLRF2D3W0D1 207 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 DDAH1O94760 285 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ICAM1P05362 532 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PGK2P07205 417 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 FDX1P10109 184 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 FCER1AP12319 257 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 RPS6KB1P23443 525 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 LIFRP42702 1097 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 USH1GQ495M9 461 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 Q6ZUG5 572 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MICU3Q86XE3 530 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 JMJD4Q9H9V9 463 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 VAT1LQ9HCJ6 419 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 RNF146Q9NTX7 359 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 MYH7BA7E2Y1 1941 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 POTEFA5A3E0 1075 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 NFIBO00712 420 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CYTH3O43739 400 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 STRNO43815 780 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PLEKHA8P1O95397 391 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 HMGCRP04035 888 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 COPB2P35606 906 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 APOBRQ0VD83 1088 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 APOA5Q6Q788 366 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 DPP9Q86TI2 863 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 SGMS1Q86VZ5 419 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 HOMER1Q86YM7 354 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ABRAQ8N0Z2 381 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CHST13Q8NET6 341 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 FGD4Q96M96 766 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ACAD9Q9H845 621 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 HOXC6P09630 235 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CCL5P13501 91 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 PSMA5P28066 241 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CYP2C19P33261 490 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 UBXN2AP68543 259 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 KCTD2Q14681 263 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 SLC30A10Q6XR72 485 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 RUFY3Q7L099 469 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-211ENST00000548041 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms