RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534376.1

NHSL1-209, Transcript of NHS like 1, humanhuman

TSL 3

Gene NHSL1, Length 609 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1-209ENST00000534376 KIFC2Q96AC6 838 aa14.65□□□□□ -0.06
NHSL1-209ENST00000534376 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NHSL1-209ENST00000534376 DDX11Q96FC9 970 aa14.65□□□□□ -0.06
NHSL1-209ENST00000534376 BACH2Q9BYV9 841 aa14.65□□□□□ -0.06
NHSL1-209ENST00000534376 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.65□□□□□ -0.06
NHSL1-209ENST00000534376 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NHSL1-209ENST00000534376 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.65□□□□□ -0.06
NHSL1-209ENST00000534376 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NHSL1-209ENST00000534376 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 DLL1O00548 723 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SLC27A2O14975 620 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ZBED4O75132 1171 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 HSPA4P34932 840 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 BADQ92934 168 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 CEP95Q96GE4 821 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 FAM161BQ96MY7 647 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 USP26Q9BXU7 913 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TOMM22Q9NS69 142 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 PHF24Q9UPV7 400 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 RIPK3Q9Y572 518 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 LAMA4Q16363 1823 aa14.64□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SEC24BO95487 1268 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 CYP21A2P08686 494 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 AKR1A1P14550 325 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 NT5C2P49902 561 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TLE2Q04725 743 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TRDNQ13061 729 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 KRT32Q14532 448 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SNX17Q15036 470 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SHHQ15465 462 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ORC4O43929 436 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TTLL1O95922 423 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TSPY3P0CV98 308 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TSPY8P0CW00 308 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 NECTIN1Q15223 517 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 FEM1BQ9UK73 627 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 LTBP2Q14767 1821 aa14.62□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 A0A1W2PQY0 241 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TFAP4Q01664 338 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SLFN13Q68D06 897 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ESR2Q92731 530 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 MKL1Q969V6 931 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 KRT23Q9C075 422 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 NEDD4P46934 1319 aa14.61□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 E7EWF7 191 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 POTEB2H3BUK9 544 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ATP2A1O14983 1001 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 BMP3P12645 472 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ANAPC15P60006 121 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 NCOA7Q8NI08 942 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 LAMA3Q16787 3333 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.6□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 MYH4Q9Y623 1939 aa14.59□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TSPY2A6NKD2 308 aa14.59□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 TMEM232C9JQI7 657 aa14.59□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NHSL1-209ENST00000534376 ADAMTS4O75173 837 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms