RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM60Q9H2L4 133 aa19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1-204ENST00000519651 USP17L10C9JJH3 530 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 SIPA1L1O43166 1804 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 BMP6P22004 513 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 COL4A5P29400 1685 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 NCAPHQ15003 741 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 IQUBQ8NA54 791 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 TBCKQ8TEA7 893 aa19.89■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 26.4
TSNARE1-204ENST00000519651 IKBKBO14920 756 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 SMC2O95347 1197 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 GH2P01242 217 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 CDC25AP30304 524 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 ADCY7P51828 1080 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 NEK8Q86SG6 692 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MTFR1LQ9H019 292 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 VEZTQ9HBM0 779 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM260Q9NX78 707 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 LAD1O00515 517 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 ZBTB5O15062 677 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 CDC25BP30305 580 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 TXLNAP40222 546 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 CXCL9Q07325 125 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 AGBL3Q8NEM8 1001 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 DCAF4Q8WV16 495 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM151AQ8WW52 585 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 NRBP1Q9UHY1 535 aa19.88■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 F5H6K3 240 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 KLRC3Q07444 240 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 SPATA20Q8TB22 786 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PTGS1P23219 599 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 JAG1P78504 1218 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MYL5Q02045 173 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MORC3Q14149 939 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIML1Q8N9V2 468 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 JDP2Q8WYK2 163 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 TAOK3Q9H2K8 898 aa19.87■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MYH4Q9Y623 1939 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 SPDYE2Q495Y8 402 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MLKLQ8NB16 471 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 STAMQ92783 540 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MTMR8Q96EF0 704 aa19.86■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 NEMFO60524 1076 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 CASP1P29466 404 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 E2F4Q16254 413 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP1R18Q6NYC8 613 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 RIC8AQ9NPQ8 531 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 DACH1Q9UI36 760 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PRPHP41219 470 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 KCNF1Q9H3M0 494 aa19.85■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PSME4Q14997 1843 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MYO1BO43795 1136 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 UBA7P41226 1012 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 DPYDQ12882 1025 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 KARSQ15046 597 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 CIAPIN1Q6FI81 312 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 RASSF8Q8NHQ8 419 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 CUL5Q93034 780 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 OR52Z1P0C646 297 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 MTMR14Q8NCE2 650 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.84■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PP2D1A8MPX8 630 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 NDUFB10O96000 172 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 UBE2SQ16763 222 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 QRICH1Q2TAL8 776 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PDXDC2PQ6P474 469 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 GSDMAQ96QA5 445 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM39BQ9GZU3 492 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 PSTPIP2Q9H939 334 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 IFNKQ9P0W0 207 aa19.83■□□□□ 0.77
TSNARE1-204ENST00000519651 CNTNAP1P78357 1384 aa19.83■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 STAT6P42226 847 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 HSD3B7Q9H2F3 369 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 BLZF1Q9H2G9 400 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 DISC1Q9NRI5 854 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A1W2PRG0 241 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP1A3P13637 1013 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 TNNI2P48788 182 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 NBPF9Q3BBW0 867 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC144BQ3MJ40 725 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 FKBP1CQ5VVH2 108 aa19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1-204ENST00000519651 RRAGBQ5VZM2 374 aa19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms