RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488024.1

RASSF1-208, Transcript of Ras association domain family member 1, human

TSL 2

Gene RASSF1, Length 1,385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASSF1-208	ENST00000488024	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	ICAM1	P05362	532 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	DDAH1	O94760	285 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	CHST13	Q8NET6	341 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	TRIB2	Q92519	343 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RASSF1-208	ENST00000488024	MYH6	P13533	1939 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	COBL	O75128	1261 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	SLC4A3	P48751	1232 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	TKFC	Q3LXA3	575 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	MMP19	Q99542	508 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	FBXO40	Q9UH90	709 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CCDC69	A6NI79	296 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	KLRF2	D3W0D1	207 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CPA1	P15085	419 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CCL14	Q16627	93 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	HMGCR	P04035	888 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	INHA	P05111	366 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	KCTD2	Q14681	263 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	C8orf34	Q49A92	452 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	DPP9	Q86TI2	863 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	SEC24B	O95487	1268 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	IGHA2	P01877	340 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	ALAS1	P13196	640 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	PSMA5	P28066	241 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	ACAD9	Q9H845	621 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	RNF146	Q9NTX7	359 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	PNMA2	Q9UL42	364 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	RPS6KB1	P23443	525 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	UBXN2A	P68543	259 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	MTFR1	Q15390	333 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	FBXL16	Q8N461	479 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	MTMR8	Q96EF0	704 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	PGK2	P07205	417 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CALM1	P0DP23	149 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CALM2	P0DP24	149 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CALM3	P0DP25	149 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	TRIM32	Q13049	653 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	APOA5	Q6Q788	366 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.2
RASSF1-208	ENST00000488024	CAPN15	O75808	1086 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	CYTH3	O43739	400 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	KIF5B	P33176	963 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024		Q6ZUG5	572 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	RUFY3	Q7L099	469 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	DDX11	Q96FC9	970 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	MAML3	Q96JK9	1138 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	BRCA2	P51587	3418 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	LCT	P09848	1927 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	CCL5	P13501	91 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	RXRA	P19793	462 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	ANAPC15	P60006	121 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RASSF1-208	ENST00000488024	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.74	■■■□□ 2.19

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