RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-211ENST00000482015 KBTBD13C9JR72 458 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 SLC16A2P36021 539 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 LRRC41Q15345 812 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 TTC22Q5TAA0 569 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 FGD4Q96M96 766 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 GDF15Q99988 308 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ACAD9Q9H845 621 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 RNF146Q9NTX7 359 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 RARBP10826 455 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ALAS1P13196 640 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ESR2Q92731 530 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 PGK1P00558 417 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 AKR1A1P14550 325 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 CNTN2Q02246 1040 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 FERMT2Q96AC1 680 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 TTC14Q96N46 770 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 PDHBP11177 359 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 TKFCQ3LXA3 575 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 POTEB2H3BUK9 544 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 KDM4AO75164 1064 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 RTP1P59025 263 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ARMCX2Q7L311 632 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 B4E1Z4 1266 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 BMP8BP34820 402 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ACVR2BQ13705 512 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 A0A1W2PPC1 479 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ICAM1P05362 532 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ZNF543Q08ER8 600 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 RNF180Q86T96 592 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 DGKHQ86XP1 1220 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-211ENST00000482015 ADAMTS4O75173 837 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 SNHG28P0DPA3 235 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 NSMFQ6X4W1 530 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 IQCA1Q86XH1 822 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 PHF24Q9UPV7 400 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ADCY6O43306 1168 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 CHMLP26374 656 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 TRIM60Q495X7 471 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 KATNBL1Q9H079 304 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 SNX17Q15036 470 aa22.05■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 CPVLQ9H3G5 476 aa22.05■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ASTN1O14525 1302 aa22.05■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 MYADML2A6NDP7 307 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 NT5C2P49902 561 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 PNMA1Q8ND90 353 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 ANKS1AQ92625 1134 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 KRT23Q9C075 422 aa22.04■■□□□ 1.12
UPP1-211ENST00000482015 KAT14Q9H8E8 782 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms