RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 RNF180Q86T96 592 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 FAM160B2Q86V87 743 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 MKL1Q969V6 931 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 RNF146Q9NTX7 359 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO40Q9UH90 709 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PPC1 479 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 AKR1A1P14550 325 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SDSP20132 328 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CNTN2Q02246 1040 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 AAMPQ13685 434 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TDHQ8IZJ6 230 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 GDF15Q99988 308 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ACAD9Q9H845 621 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 MYH6P13533 1939 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF213O14771 459 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 FOXP2O15409 715 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 NUCB1Q02818 461 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SMC5Q8IY18 1101 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CHST13Q8NET6 341 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 GMCL1Q96IK5 515 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SPC25Q9HBM1 224 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 VCANP13611 3396 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PQY0 241 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ORC4O43929 436 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TLE2Q04725 743 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ACVR2BQ13705 512 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ALX1Q15699 326 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 GNASQ5JWF2 1037 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 Q7L0L9 218 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ARMCX2Q7L311 632 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 BADQ92934 168 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 FAM161BQ96MY7 647 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 B4E1Z4 1266 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ATP2A1O14983 1001 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 KDM4AO75164 1064 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 FDX1P10109 184 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 RAG1P15918 1043 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CALML3P27482 149 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 BMP8BP34820 402 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 OAZ1P54368 228 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP4BP1P59074 171 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 KCNA10Q16322 511 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 USH1GQ495M9 461 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB123Q8N688 67 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF4Q8WV16 495 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ESR2Q92731 530 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 CPVLQ9H3G5 476 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 NEDD4P46934 1319 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-209ENST00000480420 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.49□□□□□ -0.89
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