RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 DEFB118Q96PH6 123 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 PNMA2Q9UL42 364 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 TFRCP02786 760 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 SLC16A2P36021 539 aa13.65□□□□□ -0.22
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NISCH-204ENST00000464280 SEC23AQ15436 765 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 TTBK2Q6IQ55 1244 aa13.65□□□□□ -0.22
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NISCH-204ENST00000464280 DDX11Q96FC9 970 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 MAML3Q96JK9 1138 aa13.65□□□□□ -0.22
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NISCH-204ENST00000464280 FLRT1Q9NZU1 646 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-204ENST00000464280 ZNF536O15090 1300 aa13.64□□□□□ -0.23
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NISCH-204ENST00000464280 SLC27A2O14975 620 aa13.64□□□□□ -0.23
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NISCH-204ENST00000464280 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
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NISCH-204ENST00000464280 CREB3L3Q68CJ9 461 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CCDC174Q6PII3 467 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 SHISA4Q96DD7 197 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 AGBL1Q96MI9 1066 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MTA3Q9BTC8 594 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 HOMER2Q9NSB8 354 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 TAF6LQ9Y6J9 622 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MSCO60682 206 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 IGHA2P01877 340 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 GOLGA8HP0CJ92 632 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 ALAS1P13196 640 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CYP2C19P33261 490 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MCM5P33992 734 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 ZNF792Q3KQV3 632 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 RNF146Q9NTX7 359 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 PFASO15067 1338 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 REC8O95072 547 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CNGA1P29973 690 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 SNAP25P60880 206 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CHST3Q7LGC8 479 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 TMEM87BQ96K49 555 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 TINF2Q9BSI4 451 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 NRBP1Q9UHY1 535 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CYBAP13498 195 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 ANTXR2P58335 489 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 KRT32Q14532 448 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 TMTC2Q8N394 836 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 UBA5Q9GZZ9 404 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 ALPK3Q96L96 1907 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 POTEB2H3BUK9 544 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 PRC1O43663 620 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 ADGRF4Q8IZF3 695 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 NEK1Q96PY6 1258 aa13.6□□□□□ -0.23
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NISCH-204ENST00000464280 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 KLRF2D3W0D1 207 aa13.59□□□□□ -0.23
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NISCH-204ENST00000464280 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 GRM4Q14833 912 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MUM1L1Q5H9M0 696 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 LHX8Q68G74 356 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 FAM133AQ8N9E0 248 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 TRPV1Q8NER1 839 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MAP3K14Q99558 947 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CPVLQ9H3G5 476 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 LY9Q9HBG7 655 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 MAD2L2Q9UI95 211 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 CNPY2Q9Y2B0 182 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-204ENST00000464280 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa13.58□□□□□ -0.23
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