RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REC8O95072 547 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ICAM1P05362 532 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP2B6P20813 491 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADORA2AP29274 412 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCM5P33992 734 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTFR1Q15390 333 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF792Q3KQV3 632 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ASPRV1Q53RT3 343 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYDE2Q5VT97 1194 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SGMS1Q86VZ5 419 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NCAPG2Q86XI2 1143 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTMR8Q96EF0 704 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPTORQ8N122 1335 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INHAP05111 366 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMARCA1P28370 1054 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GJA8P48165 433 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRT32Q14532 448 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLS1Q14651 629 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGS22Q8NE09 1264 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEK1Q96PY6 1258 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP26Q9BXU7 913 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LY9Q9HBG7 655 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SENP2Q9HC62 589 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FLRT1Q9NZU1 646 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NRBP1Q9UHY1 535 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAD2L2Q9UI95 211 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POTEFA5A3E0 1075 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRC1O43663 620 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCL5P13501 91 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC16A2P36021 539 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCTD2Q14681 263 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRM4Q14833 912 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WTAPQ15007 396 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCL14Q16627 93 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC96Q2M329 555 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CPXCR1Q8N123 301 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IL17RAQ96F46 866 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AGBL1Q96MI9 1066 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIOX1Q9H6W3 641 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERICH2A1L162 156 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SGPL1O95470 568 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GOLGA8HP0CJ92 632 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM32Q13049 653 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADCK5Q3MIX3 580 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DPP9Q86TI2 863 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM133AQ8N9E0 248 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAML3Q96JK9 1138 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FGD4Q96M96 766 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMP19Q99542 508 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AGXT2Q9BYV1 514 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDAH1O94760 285 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GHRHRQ02643 423 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR78Q5VTH9 848 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHST3Q7LGC8 479 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADGRF4Q8IZF3 695 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLEC4DQ8WXI8 215 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SHISA4Q96DD7 197 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TINF2Q9BSI4 451 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBA5Q9GZZ9 404 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF208Q9H0X6 261 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACAD9Q9H845 621 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLRF2D3W0D1 207 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RCAN1P53805 252 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SOX10P56693 466 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms