RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PPP6R2O75170 966 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM9Q13443 819 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 VPS52Q8N1B4 723 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CABS1Q96KC9 395 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 USP6P35125 1406 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC89Q8N998 374 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 GPT2Q8TD30 523 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ATP10DQ9P241 1426 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 GIPC1O14908 333 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 BCS1LQ9Y276 419 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 K7ENM7 598 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 H2AFZP0C0S5 128 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 H2AFVQ71UI9 128 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ST7Q9NRC1 585 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 VSIG1Q86XK7 387 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CRCPO75575 148 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ERBB3P21860 1342 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ADD2P35612 726 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 DENND2CQ68D51 928 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 NACA2Q9H009 215 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 AOC3Q16853 763 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 SPC25Q9HBM1 224 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 NEDD9Q14511 834 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK3O14649 394 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CUL4AQ13619 759 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CASC4Q6P4E1 433 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 BBOX1O75936 387 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 INPP5BP32019 993 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 AK8Q96MA6 479 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 METTL13Q8N6R0 699 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.168e-7■■■□□ 14.9
CCSAP-203ENST00000366687 POTEDQ86YR6 584 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP1Q9C000 1473 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 IFNB1P01574 187 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ATP11AP98196 1134 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R5DQ14738 602 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4A11Q02928 519 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP10Q86W26 655 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-203ENST00000366687 KRIT1O00522 736 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 P3H4Q92791 437 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 POLA2Q14181 598 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 MIS12Q9H081 205 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TNNC2P02585 160 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PBRM1Q86U86 1689 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PPFIA4O75335 1185 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP25P42331 645 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms