RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 CORO7P57737 925 aa28.33■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa28.33■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 TTYH3Q9C0H2 523 aa28.33■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.33■■■□□ 2.13
SENP3-201ENST00000321337 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.32■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 ZNF263O14978 683 aa28.32■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 MEA1Q16626 185 aa28.32■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
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SENP3-201ENST00000321337 JADE2Q9NQC1 790 aa28.32■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PQC6 194 aa28.32■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 PPFIA4O75335 1185 aa28.32■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CYP2D6P10635 497 aa28.32■■■□□ 2.12
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SENP3-201ENST00000321337 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa28.32■■■□□ 2.12
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SENP3-201ENST00000321337 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 TTI2Q6NXR4 508 aa28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 IDEP14735 1019 aa28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 RASSF8Q8NHQ8 419 aa28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 DRC1Q96MC2 740 aa28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 KAT14Q9H8E8 782 aa28.31■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 DDAH1O94760 285 aa28.3■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 SRGNP10124 158 aa28.3■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
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SENP3-201ENST00000321337 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.3■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 KRT86O43790 486 aa28.3■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 LONP1P36776 959 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 KRT83P78385 493 aa28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CRACR2AQ9BSW2 395 aa28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CALM1P0DP23 149 aa28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CALM2P0DP24 149 aa28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CALM3P0DP25 149 aa28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 TRAPPC10P48553 1259 aa28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 EFCC1Q9HA90 598 aa28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 EHD2Q9NZN4 543 aa28.29■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.29■■■□□ 2.12
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SENP3-201ENST00000321337 PSMB7Q99436 277 aa28.28■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 THAP9Q9H5L6 903 aa28.28■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.28■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.28■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 EXOC1Q9NV70 894 aa28.28■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 HPS3Q969F9 1004 aa28.27■■■□□ 2.12
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SENP3-201ENST00000321337 DNM2P50570 870 aa28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 SLC7A5Q01650 507 aa28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 BLIDQ8IZY5 108 aa28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 LRRC1Q9BTT6 524 aa28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.12
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SENP3-201ENST00000321337 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.26■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CREG2Q8IUH2 290 aa28.26■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.26■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
SENP3-201ENST00000321337 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
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SENP3-201ENST00000321337 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.26■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 MCM3P25205 808 aa28.25■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 DCCP43146 1447 aa28.25■■■□□ 2.11
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SENP3-201ENST00000321337 PSMA7O14818 248 aa28.25■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 CXCR5P32302 372 aa28.25■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.25■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA6BA6NDN3 693 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 EPHB6O15197 1021 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 FCER1AP12319 257 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 STK4Q13043 487 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 INF2Q27J81 1249 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 MIIPQ5JXC2 388 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 DTHD1Q6ZMT9 781 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 ITGB4P16144 1822 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA6CA6NDK9 693 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 RHOBTB3O94955 611 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA6DP0CG33 693 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 CCT5P48643 541 aa28.24■■■□□ 2.11
SENP3-201ENST00000321337 RCSD1Q6JBY9 416 aa28.24■■■□□ 2.11
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