RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNCBQ16143 134 aa25.29■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFAP58Q5T655 872 aa25.29■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MREGQ8N565 214 aa25.29■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF233A6NK53 670 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT14P02533 472 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPN1P04843 607 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDK17Q00537 523 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMTC2Q8N394 836 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THAP9Q9H5L6 903 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHD4Q14839 1912 aa25.28■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRGNP10124 158 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFT88Q13099 833 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OSBPL9Q96SU4 736 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTRQ99707 1265 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PARP9Q8IXQ6 854 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FANCBQ8NB91 859 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.27■■□□□ 1.64
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP27A1Q02318 531 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPA17Q15506 151 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC181Q5TID7 509 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C3orf20Q8ND61 904 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GDAQ9Y2T3 454 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C8orf74Q6P047 294 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFT20Q8IY31 132 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADSSL1Q8N142 457 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTA3Q9BTC8 594 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAPBQ9H115 298 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYH6P13533 1939 aa25.26■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERICH2A1L162 156 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBPF26B4DH59 902 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PAFAH1B1P43034 410 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF174Q15697 407 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM228AQ86W67 206 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBPF15Q8N660 670 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE6AP16499 860 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SEC24CP53992 1094 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC96Q2M329 555 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYB5D1Q6P9G0 228 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FUKQ8N0W3 1084 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHISA4Q96DD7 197 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SH2D4AQ9H788 454 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GDF3Q9NR23 364 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EXOC1Q9NV70 894 aa25.25■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP2R5AQ15172 486 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TLDC1Q6P9B6 456 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC114Q96M63 670 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF3CO14782 793 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTC38Q5R3I4 469 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC121Q6ZUS5 278 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SGSM3Q96HU1 749 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CENPHQ9H3R5 247 aa25.24■■□□□ 1.63
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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