RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287538.9

ZIC3-201, Transcript of Zic family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZIC3, Length 3,469 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3-201ENST00000287538 TMEM260Q9NX78 707 aa14.52□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.52□□□□□ -0.08
ZIC3-201ENST00000287538 PPP6R2O75170 966 aa14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TADA3O75528 432 aa14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.52□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 LRP5O75197 1615 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 RESP18Q5W5W9 173 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PTPREP23469 700 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 POSTNQ15063 836 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PPP2R5BQ15173 497 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CNKSR1Q969H4 720 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CACNA1SQ13698 1873 aa14.51□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 ATP8B1O43520 1251 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 GNAQP50148 359 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 ICE2Q659A1 982 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 GJA10Q969M2 543 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TPM1P09493 284 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 NLRP12P59046 1061 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 USH1GQ495M9 461 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 YY1AP1Q9H869 796 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 NHSQ6T4R5 1651 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 UBE2SQ16763 222 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 FANCLQ9NW38 375 aa14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TUBB4AP04350 444 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TXKP42681 527 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 SEPT2Q15019 361 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CALML3P27482 149 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 UBA7P41226 1012 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 BAG6P46379 1132 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 GRM4Q14833 912 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PODNQ7Z5L7 613 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 A0A087X0B3 334 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 DPEP1P16444 411 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 FGRP09769 529 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TMC4Q7Z404 712 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 OGFOD1Q8N543 542 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 ERCC3P19447 782 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 ACTN2P35609 894 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 SLC1A4P43007 532 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 EXOC4Q96A65 974 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CSRNP1Q96S65 589 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 MTA3Q9BTC8 594 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 BCORQ6W2J9 1755 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 C4AP0C0L4 1744 aa14.48□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TECP42680 631 aa14.47□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TTLL6Q8N841 843 aa14.47□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.47□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 LAMB2P55268 1798 aa14.47□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 USP17L10C9JJH3 530 aa14.47□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 CCP110O43303 1012 aa14.47□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 UBASH3AP57075 661 aa14.47□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.47□□□□□ -0.09
ZIC3-201ENST00000287538 C6orf50Q9HD87 102 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms