RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm7347D3YYI9 267 aa24.5■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Speer4aF8VPX6 267 aa24.5■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dbndd2Q9CRD4 158 aa24.5■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tcp11Q01755 566 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ces3aQ63880 571 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 WhrnQ80VW5 918 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hs2st1Q8R3H7 356 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Exoc1Q8R3S6 894 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ces3bQ8VCU1 571 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Uba5Q8VE47 403 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem192Q9CXT7 266 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cacna1sQ02789 1880 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem132bF7BAB2 1078 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nfil3O08750 462 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpusd2Q149F1 553 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf667Q2TL60 609 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mdh1bQ5F204 500 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nek5Q7TSC3 627 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dclk3Q8BWQ5 790 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ToporslQ9D2F8 683 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clip2Q9Z0H8 1047 aa24.49■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GakQ99KY4 1305 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pip4k2aO70172 405 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc4bP0C192 709 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rfc1P35601 1131 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttll12Q3UDE2 639 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spg7Q3ULF4 781 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Papd7Q6PB75 542 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp2r5dQ91V89 594 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cabp7Q91ZM8 215 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Efhd1Q9D4J1 240 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa24.48■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kcna1P16388 495 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem232Q5K6N0 675 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem47Q9JJG6 181 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prl2c5Q9JLV9 222 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Top1Q04750 767 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccna1Q61456 421 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtss1lQ6P9S0 715 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc93Q7TQK5 629 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cep95Q8BVV7 827 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zmynd15Q8C0R7 736 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Morc2bQ8C5W4 1022 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim9Q8C7M3 817 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn1r218Q8R261 298 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lzts2Q91YU6 671 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Snrnp35Q9D384 244 aa24.47■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rgs22G3UYX5 1258 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ube3aO08759 870 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem179Q8BHH9 233 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psrc1Q9D0P7 329 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fsip1Q9D3V5 435 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cbx8Q9QXV1 362 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ercc4Q9QZD4 917 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Msh3P13705 1091 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif22Q3V300 660 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nsrp1Q5NCR9 542 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa24.46■■□□□ 1.51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nol4P60954 483 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psg29Q3URN6 468 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hook2Q7TMK6 716 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gpt2Q8BGT5 522 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bpifb4A2BGH0 617 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm3893E9Q1I1 302 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PurbO35295 324 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Snx12O70493 165 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp4cP97470 307 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc114Q3UX62 658 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myl6bQ8CI43 207 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rab3il1Q8VDV3 383 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sar1bQ9CQC9 198 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tktl2Q9D4D4 627 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa24.45■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Etnk2A7MCT6 385 aa24.44■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Foxn3Q499D0 457 aa24.44■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Irak1Q62406 710 aa24.44■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krt82Q99M74 516 aa24.44■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Chd5A2A8L1 1946 aa24.43■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pramel6Q810Y9 485 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.9 ms