RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txnrd2Q9JLT4 524 aa14.23□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa14.23□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prkab1Q9R078 270 aa14.23□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myh7bA2AQP0 1941 aa14.23□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc27a3O88561 667 aa14.23□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nek1P51954 1203 aa14.23□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tshz1Q5DTH5 1084 aa14.23□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspa4Q61316 841 aa14.23□□□□□ -0.13
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Magea3Q6T340 320 aa14.22□□□□□ -0.13
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trex1Q91XB0 314 aa14.22□□□□□ -0.13
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AllcQ9JHX6 414 aa14.22□□□□□ -0.13
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbln1Q08879 705 aa14.22□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camkk2Q8C078 588 aa14.22□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdac9Q99N13 588 aa14.22□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tubb4aQ9D6F9 444 aa14.22□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EcsitQ9QZH6 435 aa14.22□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d2B1AVH7 922 aa14.21□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc39a2G3X943 309 aa14.21□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21969J3QJZ1 289 aa14.21□□□□□ -0.13
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh15P33146 784 aa14.21□□□□□ -0.13
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
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