RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)C

tM(CAU)C, Transcript of Methionine tRNA (tRNA-Met), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tM(CAU)C, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)CtM(CAU)C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data12.08□□□□□ -0.48not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C ATP11P32453 318 aa12.08□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C GDA1P32621 518 aa12.08□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C TOM20P35180 183 aa12.08□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C SQT1P35184 431 aa12.08□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C PHO5P00635 467 aa12.07□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C YML002WP0CF17 737 aa12.07□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C PET123P17558 318 aa12.07□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C RRP1P35178 278 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C LRG1P35688 1017 aa12.07□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C PFA3P42836 336 aa12.07□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C TRS23Q03784 219 aa12.07□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C MDM35O60200 86 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C ATP12P22135 325 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C URA10P30402 227 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C NTH1P32356 751 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C TAF14P35189 244 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C FMP46P36141 133 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C YHR020WP38708 688 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C UBA4P38820 440 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C NMD5P46970 1048 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C RSM10Q03201 203 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C DIN7Q12086 430 aa12.06□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C CBF1P17106 351 aa12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C URA7P28274 579 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C TIP20P33891 701 aa12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C UTP18P40362 594 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data12.05□□□□□ -0.48not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C PMT3P47190 753 aa12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C ARH1P48360 493 aa12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C SGF73P53165 657 aa12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C YLR030WQ07967 263 aa12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C NUS1Q12063 375 aa12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C UPC2Q12151 913 aa12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C CMR1Q12510 522 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C GCR1P07261 785 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C MF(ALPHA)2P32435 120 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C MEI5P32489 222 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C THI80P35202 319 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C PLB1P39105 664 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C FAU1P40099 211 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C GAT1P43574 510 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C AAT1Q01802 451 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C CUE5Q08412 411 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C GYP1Q08484 637 aa12.04□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C TRA1P38811 3744 aa12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C STE2D6VTK4 431 aa12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C TEF1P02994 458 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C CMD1P06787 147 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C HSE1P38753 452 aa12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C YHI9P38765 294 aa12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C YHR045WP38775 560 aa12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C TRM12Q04235 462 aa12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C ENT2Q05785 613 aa12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C SYT1Q06836 1226 aa12.03□□□□□ -0.48
tM(CAU)CtM(CAU)C PTP1P25044 335 aa12.02□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C IMG1P25626 169 aa12.02□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C TPS2P31688 896 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C MVD1P32377 396 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C ALA1P40825 983 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C MST1P07236 462 aa12.01□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C MGM101P32787 269 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C YPT52P36018 234 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C YFR020WP43600 232 aa12.01□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C ESF2P53743 316 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C YAR066WP0CX18 203 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C YHR214WP0CX19 203 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C FUR1P18562 216 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C GCG1P32656 232 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C SFC1P33303 322 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C RIM11P38615 370 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C PET130P47065 347 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C CCT8P47079 568 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C COG6P53959 839 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C CDC123Q05791 360 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C MCM16Q12262 181 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C YLR111WQ12528 110 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C MEC1P38111 2368 aa12□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C AI4P03878 556 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C RAD1P06777 1100 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C BCY1P07278 416 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C HRR25P29295 494 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C SIN4P32259 974 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C RIM101P33400 625 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C PET112P33893 541 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data11.99□□□□□ -0.49not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C NDC80P40460 691 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C MAD1P40957 749 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C SAE2P46946 345 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C YJL049WP47048 450 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C GCV1P48015 400 aa11.99□□□□□ -0.49
tM(CAU)CtM(CAU)C COS12P53053 380 aa11.99□□□□□ -0.49
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