RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	VRP1	P37370	817 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YBR259W	P38338	688 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	DBP8	P38719	431 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MEP1	P40260	492 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SWC4	P53201	476 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PEX13	P80667	386 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SPO19	Q03029	223 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	NHP10	Q03435	203 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CCE1	Q03702	353 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YET2	Q04210	160 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	BUD7	Q08754	746 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ICT1	Q12385	394 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SPT23	P35210	1082 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ARP1	P38696	384 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GDH3	P39708	457 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YGR016W	P53209	190 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	VAC7	P53950	1165 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YMR155W	Q03795	547 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YOR012W	Q12351	137 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SEM1	O94742	89 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MPH2	P0CD99	609 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PUP2	P32379	260 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CSE1	P33307	960 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	LRG1	P35688	1017 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SHU2	P38957	223 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MAD3	P47074	515 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	COG7	P53195	279 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TGL2	P54857	326 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SPO20	Q04359	397 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SEC10	Q06245	871 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	VTA1	Q06263	330 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MDY2	Q12285	212 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RHO2	P06781	192 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MST1	P07236	462 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CLB4	P24871	460 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RAD14	P28519	371 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GUT1	P32190	709 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TIP20	P33891	701 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	THI80	P35202	319 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YKL151C	P36059	337 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TIM17	P39515	158 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ALG5	P40350	334 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SER33	P40510	469 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MTO1	P53070	669 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CSN9	Q03981	162 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CRN1	Q06440	651 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	UBX3	Q12229	455 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	COX6	P00427	148 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SPS1	P08458	490 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ASK1	P35734	292 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	IML3	P38265	245 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YHR078W	P38799	552 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	IRR1	P40541	1150 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YIL001W	P40560	513 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	FRE4	P53746	719 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HFD1	Q04458	532 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HPF1	Q05164	967 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HDA3	Q06623	655 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MCD1	Q12158	566 aa		5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	EXO70	P19658	623 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	VAC17	P25591	423 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PTM1	P32857	523 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	NUP120	P35729	1037 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CTP1	P38152	299 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PCL5	P38794	229 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.65	□□□□□ -1.5	not detected
AMD1	YML035C	COA1	P40452	197 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	AIF1	P52923	378 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MRM2	P53123	320 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YGL108C	P53139	140 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CLD1	P53264	445 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SLM2	P53955	656 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GOT1	Q03554	138 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RCO1	Q04779	684 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	FAR10	Q06001	478 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YPR202W	Q08993	238 aa		5.65	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HEM2	P05373	342 aa		5.65	□□□□□ -1.51
AMD1	YML035C	NMT1	P14743	455 aa		5.65	□□□□□ -1.51
AMD1	YML035C	EPT1	P22140	391 aa		5.65	□□□□□ -1.51
AMD1	YML035C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms