RNA–Protein interactions for RNA: YLR308W

CDA2, Transcript of Chitin deacetylase, yeast

Gene CDA2, Length 939 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CDA2	YLR308W	PDR8	Q06149	701 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	MCH4	Q08268	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	PGS1	P25578	521 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	AFG3	P39925	761 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	BUR6	P40096	142 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	MDV1	P47025	714 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	NNF2	P53253	936 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	ZDS2	P54786	942 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	SNA4	Q07549	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	ATX2	Q12067	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YCR006C	P25350	157 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	PXL1	P36166	706 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	UBP13	P38187	747 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	REG2	P38232	338 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	MUM2	P38236	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	PFA5	Q03289	374 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YML037C	Q03703	340 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	SCM3	Q12334	223 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	SFI1	Q12369	946 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
CDA2	YLR308W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	ATO2	P32907	282 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YBR225W	P38321	900 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	IRC6	P43615	237 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YNR061C	P53747	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	MRPL19	P53875	158 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	YEH1	Q07804	573 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CDA2	YLR308W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	CBS1	P14066	229 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	VPS41	P38959	992 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	PTR3	P43606	678 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	SGM1	P47166	707 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	VPS75	P53853	264 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	PIG1	Q06216	648 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	PET111	P08468	800 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	GPA1	P08539	472 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	RGI2	P40188	164 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	FRE3	Q08905	711 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	MET8	P15807	274 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	POL4	P25615	582 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	DBP8	P38719	431 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	YFR020W	P43600	232 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	MRX6	P48564	524 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	DSD1	P53095	428 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	EFM6	P53970	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	FIN1	Q03898	291 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	MFB1	Q04922	465 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	CDC45	Q08032	650 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	GSH2	Q08220	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	ARG81	P05085	880 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	CLB2	P24869	491 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	BOS1	P25385	244 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	YUR1	P26725	428 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	NPL6	P32832	435 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	SEF1	P34228	1148 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	MIA40	P36046	403 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	YIL152W	P40455	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	MEP2	P41948	499 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	VPS25	P47142	202 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	BOP3	P53958	396 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	DSE3	Q08729	430 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	ATG9	Q12142	997 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	UBX3	Q12229	455 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	AVL9	Q12500	764 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	YPT6	Q99260	215 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	CKA1	P15790	372 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	KAR3	P17119	729 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	STE50	P25344	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	YCR043C	P25361	127 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	GAC1	P28006	793 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	UBP11	P36026	717 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	ICS2	P38284	255 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	ELO1	P39540	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	ALG5	P40350	334 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CDA2	YLR308W	NGL3	Q03210	505 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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