RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W TIF3P34167 436 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YBR144CP34215 104 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W CMC1P36064 111 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W OTU2P38747 307 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W EXO1P39875 702 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W JEM1P40358 645 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W FAR3P46671 204 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YJL043WP47053 257 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W ART5P53244 586 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W TWF1P53250 332 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W NNF2P53253 936 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YPR003CP53394 754 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W CIK1Q01649 594 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W THI3Q07471 609 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W ULA1Q12059 462 aa4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YML133CQ03099 1374 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YLL067CQ07888 1374 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YLL066CQ99208 1374 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YCR051WP25631 222 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W PAP1P29468 568 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W SYN8P31377 255 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W MRE11P32829 692 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W RPC34P32910 317 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W WBP1P33767 430 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W APE3P37302 537 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W ELO1P39540 310 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W PTR3P43606 678 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W SMC3P47037 1230 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YGR127WP53275 312 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YNL058CP53947 316 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YOL159CQ08300 171 aa4.8□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W AQY1P0CD91 305 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W CLB1P24868 471 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W PUP3P25451 205 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W IMG1P25626 169 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YMC1P32331 307 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W VPH1P32563 840 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W EMP70P32802 667 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W OAR1P35731 278 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W MOH1P38191 138 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W HXT14P42833 540 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W BNI5P53890 448 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W PFA5Q03289 374 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W TMN2Q04562 672 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W APL4Q12028 832 aa4.79□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W BI2P03873 423 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W APN1P22936 367 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W STE50P25344 346 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W PRD1P25375 712 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W ICS2P38284 255 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W ZIM17P42844 174 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W SAE2P46946 345 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data4.78□□□□□ -1.64not detected
YKR047WYKR047W VPS9P54787 451 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W FIN1Q03898 291 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W YLR049CQ12110 428 aa4.78□□□□□ -1.64
YKR047WYKR047W SPT7P35177 1332 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RPN13O13563 156 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RAP1P11938 827 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RPL3P14126 387 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ART10P18634 518 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MNE1P24720 663 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YME1P32795 747 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YEL020CP39994 560 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W IRC24P40580 263 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W DLD2P46681 530 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W APT1P49435 187 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CTF4Q01454 927 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W TEN1Q07921 160 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W SEC39Q12745 709 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W AFI1Q99222 893 aa4.77□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W CHO1P08456 276 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W NAT1P12945 854 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W APE1P14904 514 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W BOS1P25385 244 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W URA7P28274 579 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MSS51P32335 436 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W FTH1P38310 465 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ERV46P39727 415 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W LCB2P40970 561 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W GYL1Q04322 720 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W ROY1Q04847 553 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W RTT109Q07794 436 aa4.76□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data4.75□□□□□ -1.65not detected
YKR047WYKR047W BUD14P27637 709 aa4.75□□□□□ -1.65
YKR047WYKR047W DPH2P32461 534 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.2 ms