RNA–Protein interactions for RNA: YKL115C

YKL115C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL115C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL115CYKL115C RPS10BP46784 105 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SMC3P47037 1230 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C VPS25P47142 202 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C MRX6P48564 524 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SGF73P53165 657 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C MAK10Q02197 733 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C VPS72Q03388 795 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C YML037CQ03703 340 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C PSR1Q07800 427 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C NDD1Q08887 554 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C TCO89Q08921 799 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C YPL272CQ08984 517 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C MED1Q12321 566 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C RRI2Q12348 645 aa3.43□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C VMA16P23968 213 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SGF29P25554 259 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C ATO2P32907 282 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C NPR2P39923 615 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C DPB11P47027 764 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C INA17Q02888 182 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C IZH1Q03419 316 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C MFB1Q04922 465 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C HUA2Q12134 243 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.42□□□□□ -1.86not detected
YKL115CYKL115C INP53Q12271 1107 aa3.42□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SEM1O94742 89 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C MRP13P12686 339 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C OLE1P21147 510 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C PGS1P25578 521 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SAC1P32368 623 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C PDB1P32473 366 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SAC6P32599 642 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C YKL050CP35736 922 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C UBP11P36026 717 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SRO77P38163 1010 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C YBR225WP38321 900 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C LEU5P38702 357 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C PKP2P53170 491 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SCW10Q04951 389 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C ARP9Q05123 467 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C APL4Q12028 832 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C SGS1P35187 1447 aa3.41□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C EDE1P34216 1381 aa3.4□□□□□ -1.86
YKL115CYKL115C EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C YCP4P25349 247 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C CCT6P39079 546 aa3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C ELO1P39540 310 aa3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C ESL1P40456 1118 aa3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C DIA3P52290 468 aa3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C ZDS2P54786 942 aa3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C DPB4Q04603 196 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C GRC3Q07845 632 aa3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C TEN1Q07921 160 aa3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C NOP58Q12499 511 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C CBP1P07252 654 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C CLB2P24869 491 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C ADH7P25377 361 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C PEP3P27801 918 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C RPN12P32496 274 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C STV1P37296 890 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C AFG3P39925 761 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C VRG4P40107 337 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C DOT5P40553 215 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C VPS75P53853 264 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C MCP2Q06567 569 aa3.39□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C SEC53P07283 254 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C IMP2'P32351 346 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C YEL057CP39983 233 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C YGR127WP53275 312 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C IPI3P53877 555 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C ESBP6P53918 673 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C RSM23Q01163 450 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C YDL218WQ07629 317 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C SDH5Q08230 162 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C ETT1Q08421 412 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C ATX2Q12067 313 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C YPT6Q99260 215 aa3.38□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C ARG3P05150 338 aa3.37□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C MET17P06106 444 aa3.37□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C SNF3P10870 884 aa3.37□□□□□ -1.87
YKL115CYKL115C MIA40P36046 403 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.5 ms