RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A RPN2P32565 945 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A FMP10P40098 244 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A RGI2P40188 164 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A YJR061WP40355 935 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A MAF1P41910 395 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A ATG27P46989 271 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A INN1P53901 409 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A ZDS2P54786 942 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A ATG26Q06321 1198 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A OPY2Q06810 360 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A SSP2Q08646 371 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A NDD1Q08887 554 aa2.53□□□□□ -2
RPC10YHR143W-A CDC23P16522 626 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PRE8P23639 250 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ADH7P25377 361 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A MIC60P36112 540 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A AGP2P38090 596 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YIL060WP40519 144 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YIR014WP40570 242 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SGM1P47166 707 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RPS7BP48164 190 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A DIA3P52290 468 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A CUL3P53202 744 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A CBK1P53894 756 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RIX7Q07844 837 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YOL159CQ08300 171 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A NRT1Q08485 598 aa2.52□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A BAR1P12630 587 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A VMA16P23968 213 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PGS1P25578 521 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A DBP8P38719 431 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A UBA4P38820 440 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A BUR6P40096 142 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A FET5P43561 622 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SIP4P46954 829 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SOL4P53315 255 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A BSC5P53755 489 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A NUP100Q02629 959 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YMR018WQ04364 514 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YMR317WQ04893 1140 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ADE13Q05911 482 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RDR1Q08904 546 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A TCO89Q08921 799 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A BSC1Q12140 328 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SKM1Q12469 655 aa2.51□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ARG81P05085 880 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SSH4P32343 579 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A TRS65P32893 560 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PHD1P36093 366 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A TSC10P38342 320 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ERG7P38604 731 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ARP1P38696 384 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ELO1P39540 310 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YJL070CP40361 888 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YGL260WP53056 76 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A HOS2P53096 452 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A STR3P53101 465 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PKP2P53170 491 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SMA1Q02651 245 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A EMI2Q04409 500 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ENT4Q07872 247 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A LEU9Q12166 604 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ARP6Q12509 438 aa2.5□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PUT2P07275 575 aa2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A CMK1P27466 446 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A MCM4P30665 933 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SNC1P31109 117 aa2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RGT1P32862 1170 aa2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SPC34P36131 295 aa2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RIM2P38127 377 aa2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A CCT4P39078 528 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A AZF1P41696 914 aa2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A CRZ1P53968 678 aa2.49□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PHO2P07269 559 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A SNF3P10870 884 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PMS1P14242 873 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A GLN3P18494 730 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A TYR1P20049 452 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A LAG1P38703 411 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A ANS1P38832 159 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A RTS1P38903 757 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A FAR3P46671 204 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A GUF1P46943 645 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A PYK2P52489 506 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YGL082WP53155 381 aa2.48□□□□□ -2.01
RPC10YHR143W-A YGR127WP53275 312 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.7 ms