RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YGR153WP48238 217 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PIP2P52960 996 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ROM1P53046 1155 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FMP48P53233 369 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C OKP1P53298 406 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SOK2P53438 785 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GIM3P53900 129 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C TEP1P53916 434 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SIW14P53965 281 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C KTR5P53966 522 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RSN1Q03516 953 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C VHS1Q03785 461 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CRR1Q05790 422 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YPS7Q06325 596 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SWA2Q06677 668 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CDC73Q06697 393 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MUM3Q08750 479 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YLR053CQ12026 108 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PUS9Q12069 462 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PSY3Q12318 242 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ATP14Q12349 124 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C DPH6Q12429 685 aa3.48□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MOD5P07884 428 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MIS1P09440 975 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RPL3P14126 387 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MIP1P15801 1254 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SFL1P20134 766 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C VPS34P22543 875 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CTR86P25355 563 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SNT1P25357 1226 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SYP1P25623 870 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C IRE1P32361 1115 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GSH1P32477 678 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NDC1P32500 655 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C KAP122P32767 1081 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C TOM20P35180 183 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SDS22P36047 338 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SPC34P36131 295 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MRPL3P36516 390 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MRPL7P36519 292 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GLY1P37303 387 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YBR056WP38081 501 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YBR241CP38142 488 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C APM3P38153 483 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C POP4P38336 279 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YMR262WP38430 313 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SOH1P38633 127 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C LEU5P38702 357 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C DUN1P39009 513 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ECM10P39987 644 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C DSE1P40077 573 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FMP10P40098 244 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GID8P40208 455 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ASG1P40467 964 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SEC28P40509 296 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C CCT7P42943 550 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C LSB6P42951 607 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SAE2P46946 345 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C IRC18P47056 224 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MRK1P50873 501 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PBP1P53297 722 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C NMA111P53920 997 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C COG5P53951 403 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YNL010WP53981 241 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C UBX4P54730 416 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C TBF1Q02457 562 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MRPS16Q02608 121 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C SNX41Q04053 625 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C TAF11Q04226 346 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C RAD33Q04231 177 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C GIS4Q04233 774 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C APC4Q04601 652 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C KAR5Q04746 504 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YLR297WQ05899 129 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C FAR10Q06001 478 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C VPS74Q06385 345 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C MHR1Q06630 226 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YDL121CQ07541 149 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C THI20Q08224 551 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C ISU2Q12056 156 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C OSW2Q12202 724 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C HAT1Q12341 374 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C YCL001W-BQ96VH2 84 aa3.47□□□□□ -1.85
SPT4YGR063C TDH1P00360 332 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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