RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT105	YER104W	BRF1	P29056	596 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SEC66	P33754	206 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SEF1	P34228	1148 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YPT10	P38146	199 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PIH1	P38768	344 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	UIP3	P39547	235 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	AFG3	P39925	761 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
RTT105	YER104W	ZIM17	P42844	174 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	NPA3	P47122	385 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	FIN1	Q03898	291 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	GYL1	Q04322	720 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	VTA1	Q06263	330 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	LCB4	Q12246	624 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SKS1	Q12505	502 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PCT1	P13259	424 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PRD1	P25375	712 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	BUD14	P27637	709 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	MGM1	P32266	881 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SWH1	P35845	1188 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	LHS1	P36016	881 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	POP2	P39008	433 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PES4	P39684	611 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YEL020C	P39994	560 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	MRX1	P40050	688 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	BUR6	P40096	142 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	ALG5	P40350	334 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	HXT14	P42833	540 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PMT6	P42934	759 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	FAR3	P46671	204 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	IRC8	P47046	822 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	TCB2	P48231	1178 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	DIA3	P52290	468 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	COG2	P53271	262 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	EOS1	P53938	366 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	MAK10	Q02197	733 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	UBP16	Q02863	499 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	RSM28	Q03430	361 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	ROY1	Q04847	553 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SEC39	Q12745	709 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	AFI1	Q99222	893 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	ISN1	Q99312	450 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	LAM4	P38800	1345 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	WHI2	P12611	486 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	APN1	P22936	367 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	GDA1	P32621	518 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	TFB1	P32776	642 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	EMP70	P32802	667 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PMT1	P33775	817 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	GMH1	P36125	273 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	MTG2	P38860	518 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	PKP1	P40530	394 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	MAF1	P41910	395 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	GPI8	P49018	411 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	EFM6	P53970	246 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	TRS23	Q03784	219 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SOV1	Q04748	898 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	FMP45	Q07651	309 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
RTT105	YER104W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	RLM1	Q12224	676 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	INP53	Q12271	1107 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	GPM3	Q12326	303 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	YBR144C	P34215	104 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	ECM10	P39987	644 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	ASG1	P40467	964 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	SAE2	P46946	345 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RTT105	YER104W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9

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