RNA–Protein interactions for RNA: YER068W

MOT2, Transcript of Ubiquitin-protein ligase subunit of the CCR4-NOT complex, yeast

Gene MOT2, Length 1,764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MOT2	YER068W	TPO1	Q07824	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ENT4	Q07872	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	REP1	P03871	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	PMR1	P13586	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	CBS1	P14066	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	CHS2	P14180	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	MDL1	P33310	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	TDP1	P38319	544 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	SKP2	P42843	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	FMS1	P50264	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ASE1	P50275	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	REG1	Q00816	1014 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MOT2	YER068W	COX20	Q04935	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ECM3	Q99252	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	STU1	P38198	1513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	GAL10	P04397	699 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	CLB3	P24870	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	DAL80	P26343	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	DPH2	P32461	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	CCL1	P37366	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	SAF1	P38352	637 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	MSR1	P38714	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	CTM1	P38818	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	MSS4	P38994	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	BNA6	P43619	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	GAD1	Q04792	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	ATG9	Q12142	997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	GRX6	Q12438	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	PAN1	P32521	1480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MOT2	YER068W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	AI1	P03875	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ADK2	P26364	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MEI4	P29467	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PSD1	P39006	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	FCY21	P40039	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ILM1	P47155	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	NGL3	Q03210	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ATG17	Q06410	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	VPS15	P22219	1454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ERG8	P24521	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MNE1	P24720	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STE50	P25344	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	DCG1	P32460	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YHI9	P38765	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	POP2	P39008	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YER186C	P40101	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	NCS6	P53088	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	FYV6	P53913	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	INA17	Q02888	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	NRG1	Q03125	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CRN1	Q06440	651 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TMA16	Q08687	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ATP16	Q12165	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	BBP1	Q12365	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	VCX1	Q99385	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	HIS5	P07172	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	VPS33	P20795	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PEX1	P24004	1043 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GPI10	P30777	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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