RNA–Protein interactions for RNA: YBR178W

YBR178W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBR178W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR178W	YBR178W	SUL2	Q12325	893 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	YML003W	P0CF16	290 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	SNC1	P31109	117 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	SEF1	P34228	1148 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	YLF2	P38746	405 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	SHO1	P40073	367 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	ALG8	P40351	577 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	NNF1	P47149	201 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	BSC5	P53755	489 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	TAF7	Q05021	590 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	THI73	Q07904	523 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	RDR1	Q08904	546 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YBR178W	YBR178W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	HEM15	P16622	393 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	DAL3	P32459	195 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	MRP4	P32902	394 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SDH3	P33421	198 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	LHS1	P36016	881 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	PIM1	P36775	1133 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	UBA4	P38820	440 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	VPS52	P39904	641 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	MRX1	P40050	688 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	CSM2	P40465	213 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	YPS6	P40583	537 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	VHS1	Q03785	461 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	ECM11	Q04110	302 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	ATG26	Q06321	1198 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SWA2	Q06677	668 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	ESA1	Q08649	445 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	YPQ1	Q12010	308 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	BIK1	P11709	440 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	FMT1	P32785	401 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	GEX2	P36173	615 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	VID24	P38263	362 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	BNA5	Q05979	453 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	DIC1	Q06143	298 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SSK1	Q07084	712 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SYO1	Q07395	620 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	ICL2	Q12031	575 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	PET123	P17558	318 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	YCK1	P23291	538 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	YHR131C	P38835	850 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SEO1	P39709	593 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	HAT2	P39984	401 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	HOL1	P53389	586 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	YDL009C	Q12210	107 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	HIP1	P06775	603 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	CPR4	P25334	318 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	TAF5	P38129	798 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	APM3	P38153	483 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	ECM10	P39987	644 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	GPG1	P53130	126 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	AIM32	Q04689	311 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	MLC2	Q06580	163 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	FDH1	Q08911	376 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	PSF3	Q12146	194 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SNF3	P10870	884 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SPO7	P18410	259 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	TGL1	P34163	548 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	KKQ8	P36004	724 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	ARA1	P38115	344 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	DUG2	P38149	878 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	FMP10	P40098	244 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	PAN6	P40459	309 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	CTF18	P49956	741 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	TOF1	P53840	1238 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	INN1	P53901	409 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	PEX25	Q02969	394 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	UME1	Q03010	460 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	RSM28	Q03430	361 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	YKU80	Q04437	629 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YBR178W	YBR178W	YOL057W	Q08225	711 aa		0.23	□□□□□ -2.37

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